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2022-12-06 一周小结
感谢有这个机会学习。1.学习从来都是自己的事。以前的等学的心态应改正，凡事多看、多走一步。用心做，结果不会太差的。2.引导和平台很重要，感谢生信星球花花的耐心解答。3.学习工...
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《学习小组Day6笔记--阿凡》一 Linux 环境及软件安装 1.设定工作目录 cd ~/biosoft 2.下载sh脚本 这一步我是找到该列后，看左下角显示了链接后右键复制，回到Xshell后右键直接复...
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2022-12-03 day5笔记 阿凡打开了新世界。 回答问题：1.ls输出的是横向的列表，怎样输出长格式列表用 ls -l命令 2.如何查看长格式列表中文件的大小？第5列 67字节3.查看Linux系统版本、内...
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2022-12-02 day4 R 包
dplyr五个基础函数 1.mutate(),新增列 mutate(test, new = Sepal.Length * Sepal.Width)Sepal.Length S...
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2022-12-01 day3 R 基础
1.新手牢记 R赋值为<-代码为全英模式，括号要对称向量由若干元素组成，只有1个数字或字符串时为标量，多个为向量?read.table是学习的重要手段 2.重点一 向量 复现...
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R语言学习笔记精选
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用R语言实现生物信息学的经典功能。
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个人学习生信的一点心得 欢迎讨论指摘
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一些生物信息学用到的软件，工具，介绍用法安装以及以及应用的文章 🛠 测序组装使用的Spades、canu等等 🛠 序列比对比如blast、bowtie、diamond等 🛠 多序列比对比如mega、clustalW、matff等 🛠 序列格式转化的samtools、bedtools等等 🛠 可变剪接分析的rMATS、MISO 🛠 微卫星序列查找工具misa等 🛠 call peak的工具macs2 🛠 文献下载工具Sci-hub桌面版 🛠 进化树构建工具IQtree、ggtree等 🛠 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 🛠 寻找测序中的结构变异或者SNP序列GATK、bcftools等 🛠 宏基因组组装与分析的anvi'o、QIMME 🛠 测序质量评估的FastQC、BUSCO、QUAST 🛠 可视化工具比如IGV、3D Genome 🛠 测序数据下载工具SRA Toolkit、ascp等 🛠 数据可视化的工具circos 等等
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献给写作者的 Markdown 新手指南「简书」[https://www.jianshu.com/]作为一款「写作软件」在诞生之初就支持了 Markdown，Markdown 是一种「电子邮件」风格的「标记语言」。...
