参考文献：CEL-Seq2: sensitive highly-multiplexed single-cell RNA-Seq[https://...
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单细胞：CEL-Seq2 数据分析（劝退篇） -
单细胞 Drop-seq数据分析教程DropSeq 简介 Drop-seq技术最初由麻省理工学院的McCarroll实验室开发，于2015年首次发表在《Cell》杂志上。自此以后，...
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单细胞: 将meta.data plot 到UMAP图上的几种方法这里准备了一个文件，是要将这个文件中的信息plot到umap图上，文件有3列 今天的目标就是: 将第一列barcode plot到umap上 将...
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HLA分型工具-HLA-HD
在203年还在更新的一款软件 https://www.genome.med.kyoto-u.ac.jp/HLA-HD/[https://www....
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10x VDJ web summary troubleshooting使用Cellranger vdj 流程能得到一个网页版的报告，如上图样式. 今天将对这几个指标进行解释说明,用于后续troubleshootin...
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单细胞研究联合T细胞受体分析2022年【最新进展】这篇文章是单细胞转录组（scRNAseq）和TCRseq联合分析的一个综述，介绍了目前关于这两种数据联合分析的最新进展(2022年)。 1. 介...
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mixcr3.0 软件使用MiXCR是一个通用的框架，处理从原始测序数据到定量clonotype的免疫组数据。 支持PE和SE的reads，考虑测序质量，纠正PCR错误，...
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有意思的单细胞CITEseq文库结构有意思的CITEseq文库结构。 理解CITEseq的文库结构,有助于在分析数据的过程中更好地troubleshooting. 首先来看CITE...
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10x RNAseq Cellranger结果的对应关系：
10x RNAseq数据 在用cellranger 跑完10xRNaseq数据分析后，会生成一个outs目录， 这个目录下还有一个/filter...
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【小工具】智能合并测序数据fastq的脚本
介绍： 这是一个可以自动合并数据的简易脚本 应用场景： 有一批数据有三十几个样本,测序公司返回数据时由于数据量不达标，需要加测一次，部分样本数据...
专题公告
生物信息学相关，DNA，RNA，单细胞，转录组，肿瘤免疫治疗，等领域
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