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生物数据库部分合集
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singularity 安装与使用
singularity 容器技术是一种以应用软件为中心的虚拟化技术。以应用软件为单元，将软件及所有的依赖打包成容器镜像，打包后的容器镜像可直接拷...
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使用网页工具将ensemble号批量转换成基因名我们在做数据挖掘的时候，有时候遇到的数据，提供的基因名是ensemble号，人的话是ENSG开头，比如ENSG00000141736，而我们写文...
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如何获取kegg通路的基因列表
如何获取kegg通路的基因列表？相信很多人都有这个疑惑。 哪些时候需要知道通路的基因列表？举两个例子： 在找差异基因这一步，只想针对特定通路的基...
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基因组组装和注释流程 from ChatGPT
【202301】Q:write a genome assembly and annotation pipeline for each step ...
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BUSCO 做基因组评价Benchmarking Universal Single-Copy Orthologs (BUSCO)是用于评估基因组组装和注释的完整性的工具...
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PlantCARE预测植物启动子-顺式作用元件启动子 启动子是RNA 聚合酶识别、结合和开始转录的一段DNA 序列，它含有RNA 聚合酶特异性结合和转录起始所需的保守序列，多数位于结构基因转...
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重测序分析（1）软件安装
今天开启重测序分析专题啦！恳请各位观众老爷点点关注！ 所有分析均在linux系统上完成整个重测序分析流程涉及到的软件非常多，本节介绍重测序常用软...
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iTAK：在线预测全基因组转录因子TF，转录调节因子TR与蛋白激酶PK前言 康奈尔大学，FeiLab的一个预测工具。 iTAK 是依赖于数据库的用于从蛋白质或核苷酸序列中识别植物转录因子 (TF)、转录调节因子 (...
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GToTree做进化树
How to get phylogenetic tree from kraken or bracken output file?[https:/...
专题公告
生物信息学
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