最近在做一个分析的时候,需要使用到python,而我的单细胞数据是seurat对象,所以需要转化一下,变成h5ad。关于seurat转h5ad的...
先来个简单的,之前有小伙伴咨询一篇Cell文章中的饼图,展示的是celltype比例,其实之前我们写过很多展示细胞比例的图,这里复现这个3D版的...
看到了一篇Nature的UMAP图,展示的是单细胞,但是特点是标记了celltype的同时指示了marker基因。显然这个处理很有特色,我们可以...
和之前双细胞去除一样,,单细胞转录组分析去除环境污染RNA也是一个可选的内容。为什么会出现这么一个问题呢,还是受限于目前的单细胞技术而已。通俗的...
起因是有小伙伴咨询,做柱状图的时候,怎么添加趋势线,其实很简单,添加一个线性拟合图层即可。刚好最近看到这种图,在做分组表达量箱线图或者小提琴图的...
好看的图千千万,我就中意这一款。关于作图的注释,有很多种方法,有段时间,我很中意线条式的注释。一般情况,用AI直接画挺方便,但是还是想使用代码进...
近期在看文献找图的时候,看到一篇文章,一个词走进我的眼帘,Ingenuity Pathway Analysis(IPA),很熟悉,又很陌生。熟悉...
之前微信群里小伙伴求助了一张图,是一篇NC中关于cellchat结果的展示图。特点是它的弦图不像一般图一样只展示互作数目,而是展示细胞受配体。原...
接粉丝”举报“,对于一篇Science文章中的图表感兴趣,在复现的过程中,我发现另外一张让人感觉还可以的图形,是关于富集结果的展示。富集分析真的...