先来个简单的,之前有小伙伴咨询一篇Cell文章中的饼图,展示的是celltype比例,其实之前我们写过很多展示细胞比例的图,这里复现这个3D版的正好弥补我们没有介绍过3D饼图...

先来个简单的,之前有小伙伴咨询一篇Cell文章中的饼图,展示的是celltype比例,其实之前我们写过很多展示细胞比例的图,这里复现这个3D版的正好弥补我们没有介绍过3D饼图...
最近好几个小伙伴都在用我们之前的一个bulk RNA多组差异分析函数(重启之普通R转录组分析(3):写一个通用的Deseq2多组差异分析函数[http://mp.weixin...
单细胞转录组,因为其技术原因,在很多时候,会造成双细胞的情况,一般我们进行基础的质控之后,好点的数据是没有问题的。目前也有很多算法进行双细胞的预测,但是一定要注意,无论是哪种...
有小伙伴发了一张图,是关于富集分析的,只不过展示和我们之前的不太一样,是桑基图+气泡图的形式,特点就是GO terms和其对应的关键基因用桑基图展示,GO结果用气泡图展示。这...
参考链接:https://www.bilibili.com/video/BV1ch4y1P7yS/?spm_id_from=333.999.0.0&vd_source=05b...
这里我们分享一个热图函数,是一个可视化的函数,您只需要提供作图的matrix数据即可。最近对于图形注释使用点比较上头,所以我们这个函数的列注释使用设置的·是点的注释形状。我们...
这里要写的这个热图主要是为了解决一个问题,就是关于热图的注释。而很多文章中的热图也是这种形式,可能是有PS,但是我们还是可以使用函数代码实现,所以这里我们写一下。 参考链接:...
之前一个图的做法,是一篇《cell reports》上的文章,展示marker基因的表达的时候,添加上了等高线密度图,(参考:单细胞marker基因可视化的补充---密度图与...
之前我们写过GO、KEGG的富集分析,,演示了差异基因KEGG或者GO的分析流程。其实差异基因的富集分析输入的文件只需要一组基因就可以了。所以我们发挥了专治懒病的优良传统,将...