文章题目 Chloroplot: An Online Program for the versatile plotting of organel...
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文献笔记七十二：Chloroplot~叶绿体基因组圈图可视化的新工具 -
群体结构推断软件FastStructure安装的详细指南
此款软件是基于SNP位点进行群体结构的推断，运行速度比较快一些，本文主要介绍它的详细安装步骤。一、安装fastStructure的依赖包和库：C...
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R可视化：'patchwork:合并多个R图的包''patchwork:合并多个R图的包' patchwork是基于gglot2的拼图包，它使得基于ggplot2的图形更容易拼接在同一个图层。 ...
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multiple whole genome alignment写在前面：在上亿年的进化历程中，基因组经历了大大小小的改变。从小的核苷酸突变、插入、缺失到大的基因缺失、重复、基因组重排和水平基因转移。基因组比...
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R可视化：使用R的circlize包绘制样本-物种丰度关联弦状图R作图-使用circlize绘制样本物种丰度关联弦状图 circlize图也即是弦图能较好展示样本物种丰度关联关系，先前从lyao222lll博...
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十节课，BRIG软件带你玩转比较基因组圈图Hello，小伙伴们，大家好！ 还在为CG View Server，GeneWiz browser等网址限制比较基因组数目而苦恼吗？...
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MECAT2: 三代高效组装工具
MECAT2是三代测序数据PacBio的高效组装工具，是之前MECAT的改进版, 修复了之前的很多bug, 使用基于string graph的f...
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NGS 数据过滤之 Trimmomatic 详细说明
tags： Trimmomatic NGS fastq NGS 原始数据过滤对后续分析至关重要，去除一些无用的序列也可以提高后续分析的准确率和效...
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【单细胞转录组】TooManyCells识别并可视化单细胞进化枝简介： https://www.nature.com/articles/s41592-020-0748-5 https://www.biorxi...
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基因组浏览器、BAM文件可视化工具（1）--- Tablet在高通量测序数据的处理中（例如，在重测序研究、组装结果的re-mapping校正中），我们经常会将测序reads与参考序列进行比对（常见的如BW...
专题公告
一些生物信息学用到的软件，工具，介绍用法安装以及以及应用的文章
🛠 测序组装使用的Spades、canu等等
🛠 序列比对比如blast、bowtie、diamond等
🛠 多序列比对比如mega、clustalW、matff等
🛠 序列格式转化的samtools、bedtools等等
🛠 可变剪接分析的rMATS、MISO
🛠 微卫星序列查找工具misa等
🛠 call peak的工具macs2
🛠 文献下载工具Sci-hub桌面版
🛠 进化树构建工具IQtree、ggtree等
🛠...
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