发简信
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免费Linux系统和生信宝典原创学习教程
生物信息的学习离不开Linux系统，不管自己写命令处理数据，还是使用现有的工具。Linux对我们来讲最重要的是它强大的命令行功能，可以快速、批量、灵活的处理数据的提取、统计和...
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上海拜谱生物（Bioprofile）作为一家高新技术企业，在生物技术领域和质谱检测领域不断深耕发展并具备关键的核心竞争力。公司致力于通过产品和服务，帮助科研专家克服组学研究和精准医疗研究带来的重大挑战，造福人类。同时，Bioprofile依托创新，着重可持续发展提升自身实力并创造价值。在中国，Bioprofile品牌代表着可信、可靠及优质。<br><br>Bioprofile拥有多项发明专利。公司提供蛋白质组学、代谢组学、基因组学和转录组学技术服务，同时投入巨大研发精力为精准医疗提供最新产品和检测手段。<br><br>目前，公司服务已经覆盖了中国50多个城市和地区，拥有360+合作单位，为3000多位合作伙伴提供了完善的技术服务。公司科研成果积累丰富，截至2020年7月，公司累计参与发表100+篇文章，在全技术，优服务，多创新的前提下，Bioprofile一直坚持为科研专家打造更全面、更专业、更高效的技术支撑。我们怀着敬畏之心提供最优质的生命科学解读，助您实现创想到成果的直接转化。
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m6a RNA甲基化测序分析流程 rna甲基化研究方法
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药企/转化医学平台相关的NGS业务大都外包给测序公司，但是药物研发人员往往对NGS的技术指标、验证转产等环节缺乏了解，另外一些业务成熟的测序公司流水线操作以及一些业务不成熟的测序公司的搅局行为，都可能会使得转化医学研究中的biomarker确认、临床入组等环节出现偏误，从而增加药物研发的人力和物力成本。这里就NGS技术在肿瘤体细胞突变检测、RNA-seq转录组分析以及溶瘤病毒基因组denovo组装中的一些注意事项做简单介绍，希望对药物研发中涉及到NGS相关工作有所帮助！不足的地方请及时留言指出！
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收集各种单细胞测序数据分析方法
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感谢各位大佬 比心
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利用全基因组和外显子组测序分析snv,cnv,sv等突变形式
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一些生物信息学用到的软件，工具，介绍用法安装以及以及应用的文章 🛠 测序组装使用的Spades、canu等等 🛠 序列比对比如blast、bowtie、diamond等 🛠 多序列比对比如mega、clustalW、matff等 🛠 序列格式转化的samtools、bedtools等等 🛠 可变剪接分析的rMATS、MISO 🛠 微卫星序列查找工具misa等 🛠 call peak的工具macs2 🛠 文献下载工具Sci-hub桌面版 🛠 进化树构建工具IQtree、ggtree等 🛠 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 🛠 寻找测序中的结构变异或者SNP序列GATK、bcftools等 🛠 宏基因组组装与分析的anvi'o、QIMME 🛠 测序质量评估的FastQC、BUSCO、QUAST 🛠 可视化工具比如IGV、3D Genome 🛠 测序数据下载工具SRA Toolkit、ascp等 🛠 数据可视化的工具circos 等等
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记录数据分析过程中遇到的那些让我涨知识的坑，生信札记
