前言 DNA 甲基化在许多细胞进程中扮演重要的角色，例如胚胎发育、基因印迹、X 染色体失活和维持染色体稳定性。 在哺乳动物中，DNA 甲基化很少...

Tumors are often characterized by an imbalance in cytosine methylation a...

DSS (Dispersion Shrinkage for Sequencing data)，为基于高通量测序数据的差异分析而设计的Biocon...

FEM是一个整合RANSEQ和DNA甲基化数据的R包，由Andrew E. Teschendorff 和 Zhen Yang 开发、维护。 不多...

参考文章：1.甲基化芯片入门学习-ChAMP包（二）2.TCGA数据库的癌症甲基化芯片数据重分析3.TCGA甲基化芯片数据质控和过滤4.甲基化芯...

1.甲基化①ChAMP帮助文档译[上]-甲基化分析流程(The Chip Analysis Methylation Pipeline) 6.Ch...

火山图有误，已更新 前情提要 前面两个步骤已经完成了数据下载、探针过滤、数据质控、样本过滤。 此处需要补充两个知识点： beta值的生物学意义 ...

在step1中，我们获得了TCGA中OSCC 的32个病人的T-N配对样本和对应的临床信息,并将其组成了一个名为my_Load的ChAMP对象。...

4.将差异甲基化位点拿来做批量生存分析 logrank test批量生存分析 这里和TCGA系列里的内容是一样的，详见：两种方法批量做生存分析 ...

【基本流程】Bismark—Methylkit—Genomation—GO/KEGG 只求自己记得 如果有人搜到了这个 请你只看上面的四个基本流...