发简信
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简书答疑公告
其实我转移到了别的平台，简书很久才看一次，评论看到的时候基本已经过去很多天，另外平时工作繁忙，很少有功夫回复。如果是跟我的教程学习，有卡住的情况...
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不看KM-plot，不做cox回归，怎么量化哪个组的预后好背景知识 讲课讲到批量的logrank test可以告诉我们两个组之间的生存率差别是否显著，收到提问说： 老师，刚才的 生存分析中，展示了所有基...
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富集的物种不是人咋整啊1.ID转换 首先是要转换ID,拟南芥是要TAIR id来做富集分析。怎么知道的呢？ 如果拿ENTRIZID来做，会收到这样式的报错信息： 那我...
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WGCNA（一）案例：研究苹果的果皮颜色机制任务驱使，直接看代码不明白是在干嘛。所以找了基因课的WGCNA课程来看，链接：http://genek.tv/[http://genek.tv/...
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python 单细胞scanpy流程1.数据和包准备 著名的pbmc3k数据：https://cf.10xgenomics.com/samples/cell/pbmc3k/pbmc...
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一个数据里两种分组信息怎么做差异分析1.背景知识 众所周知，limma可以做基因表达芯片和转录组数据的差异分析，可以方便的得处两组之间有表达量差别的基因。多分组差异分析其实也是两两...
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什么？一个单细胞样本变成俩了？1.背景知识 众所周知，单细胞转录组数据的输入文件是多种多样的，详见:不同文件格式单细胞数据读取流程 https://mp.weixin.qq....
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log10数据要当心基因表达芯片的数值范围是需要关注的信息。 可以从箱线图上面看出大部分的端倪。 特殊数据看过来 这个数据的范围是在0-4之间的。正常的log之后的...
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trans_array：探针表达矩阵转换为基因表达矩阵 [TOC] #### 0.背景知识 trans_array这个函数的作用是讲探针表达矩阵转换为基因表达矩阵。 因为探针和基因不是...
[TOC] 0.背景知识 trans_array这个函数的作用是讲探针表达矩阵转换为基因表达矩阵。 因为探针和基因不是一一对应的关系，会存在多个...