代谢组学是系统生物学的重要组成部分，它通过全面分析生物样本中的小分子代谢物来研究生物系统的代谢状态。在代谢组学研究中，从原始质谱数据到可解释的生物学信息的转化过程是至关重要的...
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代谢组学数据分析：从原始文件到代谢物表达矩阵
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GO、KEGG等富集棒棒图原文教程链接：R 语言绘图 | GO、KEGG等富集棒棒图[https://mp.weixin.qq.com/s/RfpBX-VPPWAI_CrEptQFpg]
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Linux中多线程压缩软件 | Mingz原文链接：Linux中多线程压缩软件[https://mp.weixin.qq.com/s/4wpJDag0pvieDwJD-iTm0w] 本期教程 软件网址： 安装： 使用...
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单细胞拟时序分析1-基因及通路随拟时表达变化趋势单细胞拟时分析：基因及通路随拟时表达变化趋势 - 简书 (jianshu.com)[https://www.jianshu.com/p/ff44b8df55ac] 文章链接早...
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单细胞拟时分析：基因及通路随拟时表达变化趋势
之前给小伙伴做分析复现的时候，接触到一篇Cell文章的拟时分析，参考文献：Single-cell landscape of the ecosystem in early re...
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联合 RNA 和 ATAC 分析：SNARE-seq引言 本文[https://stuartlab.org/signac/articles/snareseq]将带您分析一个单细胞联合检测数据集，该数据集能够同时测量细胞内的基因...
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Seurat v4 与 v5 数据整合工作流的技术差异说明批次效应 是指在实验中由于不同的实验条件、操作人员、试剂批次、设备差异等非生物学因素引起的系统性差异。具体来说，在单细胞RNA测序（scRNA-seq）中，不同的实验批次可能...
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spike-in的那些事日常掰瞎 第一眼看到spike-in这个词，首先想到了以下两个问题： spike-in是什么？ 所谓spike-in就是适用于所有应用的掺入质控品，包含多个不同的 D...
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CibersortX的替代者BayesPrism用单细胞数据去卷积得到普通转录组细胞类型比例CibersortX网站是常用的工具，但是是网页上传数据，现在网页503打不开，而BayesPrism在PMID: 37717006[https://pubmed.ncbi....
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卑微的生信人，如果我的帖子对你有帮助，麻烦点点赞哦
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怎么去进行基因组的组装有很多伙伴，都在进行基因组的组装，但是具体需要干什么，从什么地方开始，下一步又应该做什么?并不是很了解。我用下面一份流程图来简单的说一下，整个基因组组装应该做些什么。也是我组...
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秘籍 | 惊了，使用aspera下载SRA数据速度高达 291Mb/s
2024年5月20日更新：目前大家可以参考这篇👇，更加方便：生信 | 超便捷！iSeq同时支持快速下载GSA/SRA/ENA的数据[https://www.jianshu.c...
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生信 | 三维基因组技术（五）：TAD 分析流程写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.TAD 2.TAD分析流程...
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生信 | 三维基因组技术（四）：Compartment 分析流程写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.Compartment计算...
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生信 | 三维基因组技术（三）：Hi-C 数据比对及HiC-Pro的使用写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.Hi-C原理简介 1.1 ...
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生信 | 三维基因组技术（二）：Hi-C辅助组装与Lachesis的使用写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.Hi-C 辅助组装（PGA...
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生信 | 三维基因组技术（一）：简单介绍写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.基因组空间三维结构与功能 ...
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生信 | 基因组组装实战（六）：基因组质量、一致性、保守性、LAI等评估写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.基因组组装指标评估 为什么...
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生信 | 基因组组装实战（五）：三代数据纠错gcpp、racon写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.三代数据纠错 ：gcpp[...
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生信 | 基因组组装实战（四）：组装软件mecat2、flye、wtdbg2、Canu、Falcon写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.基因组概念 基因组应该指单...