
关于细胞互作可视化,我们的内容已经很多了,小伙伴依然有其他中意的内容,这里复现一篇cancer cell图表,使用Edge bunding pl...
这是我们circle系列的最后一节,我想常见的弦图是绕不开的,所以最后从前面介绍的circle plot思路,做一遍弦图。其实前面的内容如果消化...
高端复杂的UMAP复现: 这又是一个高大上且炫酷的单细胞UMAP图,展示的信息很多,有大类细胞和亚群,以及marker基因和cell count...
针对近期多个粉丝咨询环形图的绘制,我意识到,我们似乎没有真正介绍过circle图,但这一类图确是非常常用的图,所以这里详细学习一下circle的...
热图我们做过很多,参照公众号热图系列,这里介绍三角热图的绘制,演示corrplot的参数设置。为了让演示有意义,这里的热图数据使用单细胞亚群相关...
这里我们要复现和学习的是一篇nature文章的图表,这篇文章提供了figure的代码以及数据,我们要复现的是Figure1b。图很简单,就是两部...
这个问题我们之前提到过,很多小伙伴可能看到某些文章中这样的可视化,很感兴趣,其实熟悉python分析的小伙伴一眼就可以看出是scanpy出图,虽...
NMF:非负矩阵分解,大家应该不会陌生,大家或多或少的听说过,我们之前介绍一个R包geneNMF(GeneNMF: 基于NMF(非负矩阵分解)的...
在写NMF帖子的时候,需要plot基因热图,参考:(高分SCI单细胞图表:多层注释热图函数[https://mp.weixin.qq.com/s...