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R package：metID(七)：代谢物的鉴定metid包来源于MetDNA中用于二级谱图匹配的算法，并进行了优化，又新加了能够用于in-house代谢物库构建的功能。 1. metid包的安装 metid是tidyma...
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TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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【miRNA-Seq 实战】二、准备分析数据，差异分析以及靶向基因预测这里是佳奥！了解了大致流程，我们开始正式的分析实战。 本次实战的数据来源是这篇文章：EBV-miR-BART8-3p induces epithelial-mesenchym...
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10X单细胞（10X空间转录组）数据分析之转录因子的分析方法与解读作者，追风少年i 最近呢，收到了很多粉丝的提问，其实关于多样本通讯分析比较的内容我已经在单细胞个性化分析之多样本细胞通讯比较篇[https://www.jianshu.com...
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【单细胞组学】scCITE-seq（单细胞转录组+细胞表面蛋白表达）单细胞水平的测序技术发展的越来越快，目前应用最多的是集中于mRNA表达的scRNA-seq和结合了空间信息的空间转录组。在此基础上，还发展出了其他变种，比如snRNA-seq...
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单细胞测序实战（第一部分）这次要练习的文章数据出自：Spatially and functionally distinct subclasses of breast cancer-associated...
