开发技术 前端：vue.js、echarts 后端：springboot、vue.js 数据库：mysql 大数据计算框架：spark、hadoop 算法(机器学习、人工智能...
发简信
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计算机毕业设计Python+Spark+LSTM中药推荐系统 中药大数据可视化 中药数据分析 中药可视化系统 中药知识图谱 -
R package：metID(七)：代谢物的鉴定metid包来源于MetDNA中用于二级谱图匹配的算法，并进行了优化，又新加了能够用于in-house代谢物库构建的功能。 1. metid包的安装 metid是tidyma...
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TCGA数据差异分析后生存分析（批量单因素cox回归/Lasso筛选，多因素cox建模，时间依赖ROC曲线及KM plot可视化）测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline：从raw r...
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TCGACox
TCGA Cox模型-训练集、内部验证集、外部验证集综合构建Cox风险模型③
前面我们已经进行了单因素Cox回归，LASSO回归及多因素Cox回归建模，而我们想对建好的模型进行验证，本例通过内部验证组和外部验证组对Cox模型进行内部验证和外部验证，并对...
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公众号：误入BioInfor的大黄鸭
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不是ids，这篇文章的b这个探针，基因名矩阵
多分组芯片数据的差异分析-升级版
1.背景知识 今天的目的是为了从一个5分组数据中筛选出两个分组，去做后续分析。扩展了一下，5个分组的数据其实也可以直接一步到位作差异分析的。 数据编号：GSE54238实验设...
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博主，提个小意见，这个函数能不能优化一下啊？不要把ids作为必须输入条件，因为有些基因注释是提前弄好的
多分组芯片数据的差异分析-升级版
1.背景知识 今天的目的是为了从一个5分组数据中筛选出两个分组，去做后续分析。扩展了一下，5个分组的数据其实也可以直接一步到位作差异分析的。 数据编号：GSE54238实验设...
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【miRNA-Seq 实战】二、准备分析数据，差异分析以及靶向基因预测这里是佳奥！了解了大致流程，我们开始正式的分析实战。 本次实战的数据来源是这篇文章：EBV-miR-BART8-3p induces epithelial-mesenchym...
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10X单细胞（10X空间转录组）数据分析之转录因子的分析方法与解读作者，追风少年i 最近呢，收到了很多粉丝的提问，其实关于多样本通讯分析比较的内容我已经在单细胞个性化分析之多样本细胞通讯比较篇[https://www.jianshu.com...
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细胞通讯-2单个数据集进行细胞间通讯分析单个数据集分析，多个数据集比较分析，具有较大成分差异的数据集比较分析。本教程是单个数据集分析流程 此教程概述了使用 CellChat 的单个数据集对细胞通信网络进行推断、分析...
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【单细胞组学】scCITE-seq（单细胞转录组+细胞表面蛋白表达）单细胞水平的测序技术发展的越来越快，目前应用最多的是集中于mRNA表达的scRNA-seq和结合了空间信息的空间转录组。在此基础上，还发展出了其他变种，比如snRNA-seq...
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单细胞测序实战（第一部分）这次要练习的文章数据出自：Spatially and functionally distinct subclasses of breast cancer-associated...
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R语言--并行计算包（parallel、foreach）
R语言是单核计算语言，在数据建模或计算过程中，常常出现相同或相似任务的重复计算，一般操作是for循环处理或采用apply族函数处理，为了更快完成计算，采用并行计算是更优的选择...
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用clusterProfiler做GSEA之前写过用clusterProfiler做GSEA,enrichplot中的gseaplot作图，但是图没有最新版enrichplot包的gseaplot2做的图好看。此外，...
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单细胞文献-3带代码 严重COVID-19患者的外周免疫反应单细胞图谱A single-cell atlas of the peripheral immune response in patients with severe COVID-19 ...
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