发简信
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简书答疑公告
其实我转移到了别的平台，简书很久才看一次，评论看到的时候基本已经过去很多天，另外平时工作繁忙，很少有功夫回复。如果是跟我的教程学习，有卡住的情况...
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python版的singler单细胞注释工具网上可以搜到大量的R语言singleR的代码和教程，但python版的就比较少啦，恭喜你找到了我。 1.文件读取 输入的数据是10X标准的三个文...
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gseapy-python版的富集分析本文比较长，长到需要一个目录ORA1.输入数据之基因2.输入数据之基因集合2.1 可以是预设的基因集合名称2.2 可以是来自msigdb网站的g...
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python单细胞数据的基因集打分1.R包和数据准备 随便一个h5文件即可。我这里使用的是pbmc3k，scanpy推文最后生成的文件就是它。 2.获取用于评分的基因集合 基本上...
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不看KM-plot，不做cox回归，怎么量化哪个组的预后好背景知识 讲课讲到批量的logrank test可以告诉我们两个组之间的生存率差别是否显著，收到提问说： 老师，刚才的 生存分析中，展示了所有基...
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富集的物种不是人咋整啊1.ID转换 首先是要转换ID,拟南芥是要TAIR id来做富集分析。怎么知道的呢？ 如果拿ENTRIZID来做，会收到这样式的报错信息： 那我...
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WGCNA（一）案例：研究苹果的果皮颜色机制任务驱使，直接看代码不明白是在干嘛。所以找了基因课的WGCNA课程来看，链接：http://genek.tv/[http://genek.tv/...
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python 单细胞scanpy流程1.数据和包准备 著名的pbmc3k数据：https://cf.10xgenomics.com/samples/cell/pbmc3k/pbmc...