发简信
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内容复习--Spatial niche与Spatial邻域communications作者，Evil Genius 今天我们复习。 Spatial niche这个分享过很多次了，今天再优化一下，重点是Spatial communi...
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OmicVerse---bulk、单细胞、空间基础分析框架（重点是cNMF）作者，Evil Genius 今天我们分享一个分析框架，文章在 框架内容很多，基于python的全流程。 文章的第一作者也发布了一篇文章作为介...
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文献分享---乳腺癌复发肺转移的空间多组学分析作者，Evil Genius 今天我们分享文献，虽然IF不高，但是很多分析方法很好。 知识积累 原发性乳腺癌（BC）和转移性肿瘤具有不同的肿瘤微...
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方法分享---利用TACIT解卷积空间多组学中细胞类型和状态作者，Evil Genius 现在的日子，关税在涨，物价在涨，钱是越来越难挣了。 什么东西在跌呢？工资在跌，房价也跌，房租反而涨了，生活的压力感...
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方法汇总---Xenium、CosMx大panel细胞通讯的分析思路作者，Evil Genius 今天我们继续分享分析思路，针对Xenium、CosMx大panel，Xenium现在更新到5000+了，CosMx...
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绘图代码---细胞邻域聚类与CN细胞热图（Xenium、CODEX、CosMx）作者，Evil Genius 今天我们来画画图 需要做的内容 1、获取空间细胞邻域矩阵 2、针对细胞邻域矩阵进行聚类（leiden） 3、聚类的...
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思路分享---关于WES联合单细胞RNA检测CNV的讨论作者，Evil Genius 之前提到过，对于肿瘤来讲，绝大部分的诱发因素并不是CNV，而是突变，随着认识的越来越深入，单细胞检测CNV的准确性...
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多组学文献分享--高危神经母细胞瘤的纵向单细胞多组图谱揭示了化疗诱导的肿瘤微环境重建作者，Evil Genius 今天我们分享文献，Xenium 5k的文章。 WES + scRNA + scATAC + Xenium + CO...
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内容复习--Xenium 5k (包括CosMx大panel)基础与多样本整合分析作者，Evil Genius 今天偷个懒，梳理一下Xenium 5k的多样本整合分析。 为什么要说明是多样本整合呢？因为一张芯片大家都放好几个样...