作者,Evil Genius 我们今天更新一个内容,那就是visium的通讯分析。 最近也接触了很多分析空转的人,从我的角度来看,我觉得很多人还...
作者,Evil Genius 高精度平台(Xenium、CODEX、CosMx)的空间细胞邻域niche分析。 核心就是一定距离内的细胞(win...
作者,追风少年i 我们来复习复习吧。 2025年,希望霉运散去,一切向好。 前段时间有粉丝觉得NMF之前的代码都太复杂了,看看能不能来个简单版本...
作者,追风少年i 年前我们就不过多往前走了,复习复习吧。 大家最近也应该感觉到了,针对不同类型的空间平台,有一些分析是通用的,但是有些分析是各个...
作者,追风少年i 今天我们继续距离分析,这个分析在空间转录组是比较关键的一环。 之前分享的距离分析文章,主要针对区域和细胞类型的关系, 脚本更新...
作者,追风少年i 今日目标 discover cellular niches differentially enriched in spatia...
作者,Evil Genius 今天我们需要实现的目标 看看方法部分 其实就是CNV分数矩阵做均一化,PCA降维,然后采用miloR进行聚类分析,...
作者,Evil Genius 今日分享文献 分享之前简单复习一下10X单细胞数据分析CNV的注意事项,大家学习的时候多看看细节。 1、采用的矩阵...
作者,Evil Genius 腊八了,大家好啊。 年前我们就不过多往前走了,今天我们来学一学如何组图吧,图片是文章的门面,我们组一张。 我们来实...