作者，Evil Genius 低谷期怎么过？自己不放弃自己，一切都还有希望。 今天我们分享文献，个人看到的第一篇Stereo-seq有采用细胞分割的文献。 知识积累 动脉粥样...
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文献分享---人动脉粥样硬化斑块中三级淋巴样器官结构的单细胞空间转录组学研究（Stereo-seq） -
文献分享---基于多视图图神经网络解释niche细胞间通讯作者，Evil Genius 马上端午佳节了，大家有什么想玩的地方么？ 大家还是要早点结婚，晚了就剩下了。 结婚还是挺累的。 今天我们分享文献 关于空间的通讯分析，其实分享了...
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课程脚本更新---python版本的细胞共定位分析作者，Evil Genius 今天继续更新脚本，共定位分析是空转分析的必修课。 R版本的分析已经分享了很多次了，主要就是mistyR，大家感兴趣可以回看，今天我们主要更新到p...
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知识积累--python版本的生物学通路与富集分析（MSigDB、progeny）作者，Evil Genius 今天我们分享一些python版本的生物学通路和富集分析策略。 首先是 PROGENy 文献在 异常的细胞信号可以导致癌症和其他疾病，是药物研究的...
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脚本准备---细胞邻域差异分析（不同组）作者，Evil Genius 课程临近了，所有的内容都要准备好，今天我们来完善不同组之间的细胞邻域差异分析。 健康状态与疾病状态的细胞空间排布发生了变化，找到这种变化，这是我...
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文献分享--气道壁的单细胞空间图揭示了促炎细胞生态系统及其在健康和哮喘中的相互作用作者，Evil Genius 最近结婚去了，很多问题回复不及时，辛苦大家理解。 低谷期怎么过？自己不放弃自己，一切都还有希望。 今日我们分享文献 知识积累 确定细胞在组织内的...
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多组学文献分享---Mosaic Focal Cortical Dysplasia单细胞基因分型和转录组学分析（突变 + 单细胞 + 空间）作者，Evil Genius 今天我们分享多组学文献 知识积累 Focal cortical dysplasia type II（FCDII）是一种皮质畸形引起难治性癫痫。 ...
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方法分享---依据细胞邻域识别空间组织区域（windows策略）作者，Evil Genius 低谷期怎么过？自己不放弃自己，一切都还有希望。 今天我们分享方法论。 Kasumi，一种用于识别跨样本和条件持续存在的细胞内和细胞间关系的空间局...
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脚本更新---空间转录组多样本细胞niche分析（R版本）作者，Evil Genius 课程临近了，要准备好脚本了，当然了，即使没什么人上课，准备好的脚本项目中也都能用。 今天我们需要更新的内容是R版本的多样本细胞niche，针对v...