发简信
IP属地：贵州
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(ERR): hisat2-align died with signal 13 (PIPE)
运行命令 原因：提交任务指定的核数和命令里指定的核数不一致。
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Linux服务器安装fastp，Hisat2, samtools和Htseq
cd /work/home/acwnw4bl7y/HT22/HT22export PATH=/work/home/acwnw4bl7y/srat...
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Linux服务器安装sratoolkit
查看服务器版本 注：RPM为Centos系统下载并解压安装包 加入环境变量或每次运行前运行命令 测试 参考资料： Windows安装Aspera...
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新格元Celescope（二）：celescope rna mkref构建单细胞比对的基因组索引文件
使用方法 1 下载基因组序列和基因组注释文件 大鼠基因组和注释文件：Rattus_norvegicus - Ensembl genome bro...
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新格元CeleScope（一）：软件安装
测试 显示报错： 提示找不到 libcrypto.so.3，重新安装openssl 提示不兼容 主要是和htslib不兼容，安装指定版本的hts...
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Cell Ranger(二)：cellranger mkref构建单细胞比对的基因组索引文件参考资料： Build a Custom Reference for Cell Ranger (mkref) - Official 10x Ge...
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Cell Ranger(三)：cellranger count生成单细胞基因表达矩阵Cell Ranger需要在高配置的集群上才可以运行。将以下三个文件（解压后的Cell Ranger软件，测序数据，参考基因组）上传到服务器端。...