这一篇会在 从零开始学CIRCOS绘制圈图(二)基础上开始在circos绘制基因密度信息。为了保证一致性,可以新建如下几个文件 circos.conf: karyotype....
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好了,这一篇回归我们的主业,分享单细胞空间联合分析的运用,参考文章在Non-lesional and Lesional Lupus Skin Share Inflammato...
WGCNA原理和分析流程[https://www.jianshu.com/p/9331eb5377d1] 单细胞WGCNA分析方法+随机森林[https://www.jian...
今天重读了一遍SMART-seq2的原理,发现自己之前对于template switching的反应过程的理解似乎并不合适,因此便想把自己对于模板转换反应机制的理解写下来,以...
提到寻找物种之间的同源基因,大家一般想到的是OrthoMCL (http://orthomcl.org/orthomcl/) ,OrthoMCL是现在用的最多的一款来找直系同...
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介绍 通过同一组转录组数据,做PCA和PCoA,看看分组情况。在此之前,我通常使用PCA对样本进行检测以剔除离群样本。但并不确定PCA和PCoA哪种方法在转录样本的分析中最优...
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介绍 常用的差异基因分析软件主要有DESeq2、edgeR以及Limma。其中,DESeq2适合有重复的样本(官方推荐4个以上),edgeR可以实现单个样本的差异基因分析。但...