IP属地：吉林
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3.1 GWAS：表型鉴定与记录的基本原则和原始数据处理精确的表型检测是关联分析的关键，GWAS对数量性状和质量性状都适用。 1.各类性状的特点及鉴定与考察建议 2.表型的基本处理 2.1 正态性检验 关联分析属于线性模型，要求...
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9.2 GWAS：关联分析——TASSEL（GLM/MLM/CMLM)
TASSEL是最早出现的用于动植物关联分析的软件，还可以对进化模式以及连锁不平衡进行评估，功能非常强大，要说缺点，可能就是真的有点慢。 表型数据处理在下面这篇帖子中有介绍，这...
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从统计学的角度理解RNA-seq这次是分享李婧翌团队的一篇综述《Modeling and analysis of RNA-seq data: a review from a statistical pers...
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10.GWAS：LD decay(LD衰减）—— PopLDdecay关于连锁不平衡的详细介绍在之前的帖子里有说过，这里就不再赘述，本篇主要介绍LD decay的计算。1.GWAS：原理与目的 - 简书 (jianshu.com)[https:...
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1.GWAS：原理与目的全基因组关联分析（Genome-Wide Association Study， GWAS）是以连锁不平衡（LD）为基础，利用全基因组范围内群体中高密度的分子标记，鉴定与复杂性...
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推荐一份生物信息学入门很好的参考材料链接是 https://bioinformatics.uconn.edu/resources-and-events/tutorials-2/[https://bioinfor...
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2021-11-11【文献】利用叶绿素荧光参数通过GWAS和RNA-seq鉴定大豆磷利用效率QTL和基因Title: Identification of soybean phosphorous efficiency QTLs and genes using chlorophyl...
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gaston包作图/LD.plot/三角图/（漂亮的）连锁不平衡图贴一张图博您一笑（小小镇楼） 前言 相比于四四方方的相关性图来说，有时候三角形图会让人眼睛一亮；当你见惯了方形图之后，偶见一此类图，会不会有新意、新鲜感。 1. 简单介绍一下...
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LD单倍型块图的绘制大家好，今天给大家分享一个软件(LDBlockShow)用来绘制LD单倍型块图。在文献中我们经常看到两类图会用到连锁不平衡，一类是LD衰减图，另一类就是LD单倍型块图。需要画...
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生物信息说人话系列-GWAS分析
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GWAS学习笔记（1）-何为GWAS一、何为GWAS？ GWAS（Genome-wide Association Study）是对多个个体在全基因组范围的遗传变异（标记）多态性进行检测，获得基因型，进而将基因型...
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R语言-R/qtl包学习笔记参考：Users Guide for New BCsFt Tools for R/qtl[https://cran.r-project.org/web/packages/qt...
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生信 | 基因组组装实战（五）：三代数据纠错gcpp、racon写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.三代数据纠错 ：gcpp[...
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西澳大学生物信息博士一枚<br>研究方向: 植物泛基因组与群体基因组学的挖掘<br><br>简信不回答问题，有问题发至<br>lakeseafly50@gmail.com
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<a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.cnblogs.com%2Fwangprince2017%2F" target="_blank">https://www.cnblogs.com/wangprince2017/</a> 博客园<br><br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fblog.csdn.net%2Fu010608296" target="_blank">https://blog.csdn.net/u010608296</a> CSDN<br><br>学者网<a href="https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Fwww.scholat.com%2Fwangchuang" target="_blank">http://www.scholat.com/wangchuang</a><br><br>研究之门ReseearchGate<br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=https%3A%2F%2Fwww.researchgate.net%2Fprofile%2FWang_Chuang9" target="_blank">https://www.researchgate.net/profile/Wang_Chuang9</a><br><br><br><a href="https://links.jianshu.com/go?to=http%3A%2F%2Fbbs.sciencenet.cn%2Fhome.php%3Fmod%3Dspace%26uid%3D944416%26view%3Dwc12436109" target="_blank">http://bbs.sciencenet.cn/home.php?mod=space&uid=944416&view=wc12436109</a> 科学网
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基因表达趋势分析-2：Mfuzz基因表达趋势分析-1：TCseq[https://www.jianshu.com/p/b808085c7351] Mfuzz能够识别表达谱的潜在时间序列模式，并将相似模式的基...
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RNA-seq snakemake 自动化流程教程很多，随便列两个，强烈推荐学起来，没有python基础也可以搞定 参考1参考2Snakemake搭建生信分析流程-简介snakemake使用笔记[转]snakemake-...
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使用clusterProfiler进行富集分析clusterProfiler是业界大神Y叔写的R包，看过了它的绘图就会使人沉迷于其颜值无法自拔。本文很多内容直接翻译自官方文档，加上了我的测试数据（还是以果蝇为例）。 一、...
