精确的表型检测是关联分析的关键，GWAS对数量性状和质量性状都适用。 1.各类性状的特点及鉴定与考察建议 2.表型的基本处理 2.1 正态性检验 关联分析属于线性模型，要求...
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3.1 GWAS：表型鉴定与记录的基本原则和原始数据处理 -
9.2 GWAS：关联分析——TASSEL（GLM/MLM/CMLM)
TASSEL是最早出现的用于动植物关联分析的软件，还可以对进化模式以及连锁不平衡进行评估，功能非常强大，要说缺点，可能就是真的有点慢。 表型数据处理在下面这篇帖子中有介绍，这...
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从统计学的角度理解RNA-seq这次是分享李婧翌团队的一篇综述《Modeling and analysis of RNA-seq data: a review from a statistical pers...
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10.GWAS：LD decay(LD衰减）—— PopLDdecay关于连锁不平衡的详细介绍在之前的帖子里有说过，这里就不再赘述，本篇主要介绍LD decay的计算。1.GWAS：原理与目的 - 简书 (jianshu.com)[https:...
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1.GWAS：原理与目的全基因组关联分析（Genome-Wide Association Study， GWAS）是以连锁不平衡（LD）为基础，利用全基因组范围内群体中高密度的分子标记，鉴定与复杂性...
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推荐一份生物信息学入门很好的参考材料链接是 https://bioinformatics.uconn.edu/resources-and-events/tutorials-2/[https://bioinfor...
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2021-11-11【文献】利用叶绿素荧光参数通过GWAS和RNA-seq鉴定大豆磷利用效率QTL和基因Title: Identification of soybean phosphorous efficiency QTLs and genes using chlorophyl...
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gaston包作图/LD.plot/三角图/（漂亮的）连锁不平衡图贴一张图博您一笑（小小镇楼） 前言 相比于四四方方的相关性图来说，有时候三角形图会让人眼睛一亮；当你见惯了方形图之后，偶见一此类图，会不会有新意、新鲜感。 1. 简单介绍一下...
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LD单倍型块图的绘制大家好，今天给大家分享一个软件(LDBlockShow)用来绘制LD单倍型块图。在文献中我们经常看到两类图会用到连锁不平衡，一类是LD衰减图，另一类就是LD单倍型块图。需要画...
