① 分开跑后发现是gg1 + gg2出问题存成pdf即可解决 ② 这个就比较明显，netAnalysis_computeCentrality一下就行，需要两个cellchat...
IP属地：北京
-
跑cellchat遇到的bug
-
cellchat debug小记，人家的第一次哦！目前你近几天如果初次运行cellchat，应该在运行到如下这几行命令会报错！！！ 报错如下，懂的都懂，不解释。 怎么报出的错呢？我们一步一步来看。首先我们运行了这一步命令，想...
-
课程复习----多样本进行共定位分析作者，Evil Genius 过年前我们就先停一停把，多复习复习。 这一篇我们进行多样本的细胞类型共定位分析。 但是要注意，这里的多样本指水平重复的空间样本， 不同组（例如疾...
-
研究专题 │ 基于新兴生物标志物cfRNA的前沿应用与案例研究背景 细胞外游离RNA（cell-free RNA，cfRNA)是存在体液中细胞外的RNA片段，由各种组织通过细胞代谢与凋亡，释放到循环血并游离在体液中。cfRNA包含多...
-
R可视化之pheatmap绘制聚类热图并导出聚类后基因顺序
100天生信-Day1 热图是很方便的数据可视化方法，很多情景下简单、实用。比如在拿到RNA-seq表达矩阵后大概看一个表达情况，而且可以做个聚类大体了解基因表达模式（当然样...
-
如何给Seurat对象的基因重命名？【基因名转换】2022-07-27
适用背景 在单细胞分析中，必要的一步是对每个细胞进行注释，这相当于给每个细胞打个标签，或者说起个别名，这些信息都存在@meta.data信息里，所以不用特意去更改细胞名字，S...
-
玩转单细胞(7)：修改Seurat对象基因名称玩转单细胞(2):Seurat批量做图修饰[http://mp.weixin.qq.com/s?__biz=Mzg5OTYzMzY5Ng==&mid=2247486164&i...
-
一文看懂10X VDJ
作者：童蒙编辑：angelica 01.什么是BCR和TCR B细胞和T细胞中发现的受体分别被称为B细胞受体（B Cell Receptor ，BCR）和T细胞受体（T Ce...
-
seurat和scanpy中的基因集打分函数
seurat中的 addmodulescoreSeurat的打分函数AddMouduleScore - 简书 (jianshu.com)[https://www.jians...
