大家在投稿前首先需要解决的就是投稿的规范和要求了。知道了图表制作的规范,在导出图片时就可以预先处理,如果不了解就比较麻烦。比如,如果没有了解期刊对图片清晰度的一般要求,可能导...
大家在投稿前首先需要解决的就是投稿的规范和要求了。知道了图表制作的规范,在导出图片时就可以预先处理,如果不了解就比较麻烦。比如,如果没有了解期刊对图片清晰度的一般要求,可能导...
年底复盘,发现很多知识点理解并不深入,想对这些不清晰的知识点重新梳理一下。 一、NormalizeData()归一化 考虑到文库测序深度的影响,我们需要对单细胞counts矩...
影响因子:11.1 研究概述:食管鳞状细胞癌(ESCC)是一种致命的恶性肿瘤。免疫检查点抑制剂(ICIs)为ESCC患者带来了巨大的临床益处。作者旨在通过整合多种程序性细胞死...
hello,大家好,今天周一,做一个简单的汇总,主要针对基因集打分,无论是单细胞还是空间,基因集打分都很普遍,方法也很多,我们来总结一下。 研究背景 在单细胞转录组测序中,整...
AUC允许在单细胞rna数据集中识别具有活性基因集(如gene signature,gene module)的细胞。AUCell使用曲线下面积来计算输入基因集的一个关键子集是...
文章接受,终于有空再发点笔记了😃 SCENIC_Tutorial[#scenic_tutorial]Setup[#setup]Load Packages[#load-pack...
CytoTRACE2 CytoTRACE2是 Newman Lab[https://anlab.stanford.edu/] 开发的用于预测scRNA-seq数据中细胞干性和...
第十七计 抛砖引玉以自己的粗浅的意见引出别人高明的见解。 概述 本教程演示了如何使用Seurat(> = 3.2)分析空间分辨的RNA-seq数据。尽管分析流程类似于单细胞R...
前言 如果对较大的bam文件进行操作时,往往相当耗时,所以将一个很大的bam文件分割为几个较小的bam文件,在并行进行分析可以大大缩短所需要的时间。通常来说分割的方法是用ba...