小狐狸科研绘图

大家在投稿前首先需要解决的就是投稿的规范和要求了。知道了图表制作的规范，在导出图片时就可以预先处理，如果不了解就比较麻烦。比如，如果没有了解期刊对图片清晰度的一般要求，可能导...

whitebird

年底复盘，发现很多知识点理解并不深入，想对这些不清晰的知识点重新梳理一下。 一、NormalizeData()归一化 考虑到文库测序深度的影响，我们需要对单细胞counts矩...

生信小课堂

影响因子：11.1 研究概述：食管鳞状细胞癌（ESCC）是一种致命的恶性肿瘤。免疫检查点抑制剂（ICIs）为ESCC患者带来了巨大的临床益处。作者旨在通过整合多种程序性细胞死...

单细胞空间交响乐

hello，大家好，今天周一，做一个简单的汇总，主要针对基因集打分，无论是单细胞还是空间，基因集打分都很普遍，方法也很多，我们来总结一下。 研究背景 在单细胞转录组测序中，整...

Hayley笔记

AUC允许在单细胞rna数据集中识别具有活性基因集（如gene signature,gene module）的细胞。AUCell使用曲线下面积来计算输入基因集的一个关键子集是...

尘世中一个迷途小书僮

文章接受，终于有空再发点笔记了😃 SCENIC_Tutorial[#scenic_tutorial]Setup[#setup]Load Packages[#load-pack...

尘世中一个迷途小书僮

CytoTRACE2 CytoTRACE2是 Newman Lab[https://anlab.stanford.edu/] 开发的用于预测scRNA-seq数据中细胞干性和...

Seurat_Satija

第十七计 抛砖引玉以自己的粗浅的意见引出别人高明的见解。 概述 本教程演示了如何使用Seurat（> = 3.2）分析空间分辨的RNA-seq数据。尽管分析流程类似于单细胞R...