学习生物信息,走近生物信息学~ 生物信息学是一门跨学科研究领域,将计算机科学、统计学和数学结合,通过计算技术和算法分析生物数据,研究生物系统的结...
1、引言 BLAST 是一种基于序列相似性进行比对的常用算法。通过在数据库中搜索相似序列,BLAST 能够快速识别和注释序列的功能、结构及进化信...
一、短序列比对、双序列比对和多序列比对的区别 二、短序列比对主要是将测序的reads重新定位到基因组上,这个过程也叫回帖,mapping。 (1...
物种丰度堆积柱状图是一种常用的生态学可视化工具,用于展示不同物种在样本中的相对丰度和组成。 1、运行代码: #importdata and mo...
第4节构建WGS主流程 这是WGS数据分析的流程图。流程的目的是准确检测出每个样本(这里特指人)基因组中的变异集合,也就是人与人之间存在差异的那...
一、什么是多组学分析? Multi-omics是指在一个研究中整合和分析多种组学数据的技术和方法,这些组学包括但不限于: ① 基因组学(Geno...
第3节 数据质控 一、正式流程的搭建,整个完整的流程分为以下6部分: ① 原始测序数据 fastq 的质控 QC; ② read比对,排序和去除...
第2节 FASTA和FASTQ 其实之前有写过,FASTA和FASTQ 的部分内容。在本次就更详细地介绍一下。 首先,FASTA 和 FASTQ...
第1节 测序技术 全基因组测序的英文是Whole Genome Sequencing,简称WGS,目前默认指的是人类的全基因组测序。 所谓全(W...