240 发简信
IP属地:青海
  • Resize,w 360,h 240
    HiC术语图解与分析软件汇总

    序 言   接触HiC数据有一些时日了,想着总结一下关于HiC的一些特定术语以及数据分析的相关软件,做为备忘录的同时也可以方便后来的人。  先从...

  • Resize,w 360,h 240
    RSS指数及regulon细胞类型特异性

    RSS特异性指数   继前一篇帖子[网络CSI评估基因关联性及regulon聚类模块化[https://mp.weixin.qq.com/s/p...

    0.1 49 0 4
  • Resize,w 360,h 240
    奇怪!Input信号高于IP

      ChIP-seq实验一般会设置input作为阴性对照作为背景,这样在做peakcalling时可以去除噪音得到更真实的IP结合位点。如果使用...

    0.1 89 0 2
  • Resize,w 360,h 240
    常见组蛋白修饰要点汇总

    常见组蛋白修饰的功能、作用位点以及数据分析中信号呈现的峰形:   组蛋白修饰的功能大致分成两类:活化,对基因的转录表达起促进作用;阻遏,对基因的...

  • Resize,w 360,h 240
    ChIP-seq | motif 在转录因子数据中的应用

      Motif经常出现在表观组学文章中,在ChIP-seq数据分析中占有一席之地,尤其是转录因子。Motif中文翻译为“基序”,本质是一个基于数...

  • Resize,w 360,h 240
    ChIPseeker | 详解annotatePeak的三种注释方式

    序 言   ChIPseeker用来注释peak确实很方便,也内置了不少的可视化函数可以用来展示结果。ChIPseeker基于annotateP...

  • Resize,w 360,h 240
    macs2 | model vs nomdel

    序 言   macs2作为callpeak的工具提供了双峰模型来矫正信号的功能,使得到的信号可以呈现为一个单峰。下面用一张图来说明软件做的事情,...

  • Resize,w 360,h 240
    有些软件总能以某种方式劝退你 | SpectralTAD 之 TAD calling

    序 言   有些软件总能以某种形式劝退你,让你毫不犹豫的投入其他软件的怀抱,外加产生一种不吐不快的情愫,激发一种唯恐他人也会“遭此毒手”的正义感...

  • Resize,w 360,h 240
    生信分析不只是跑下软件 | TADCompare 差异分析要留心

    序 言   生信分析真的是跑下别人的软件就ok了么?很明显这样认为有些肤浅。先不说软件好不好用的事,即使勉强能够正常运行得到结果就万事大吉了么?...

个人介绍
『鹅厂号: 生信云笔记』分享生信分析及数据可视化相关的内容,欢迎关注和交流!https://1156054203.github.io