用scanpy做差异分析的时候，发现一个奇怪的现象，如果指定了reference参数，即使设置了pts参数来计算基因的在细胞群里面的表达比例，当提取差异结果的时候会发现并没有...
发简信
IP属地：澳门
-
scanpy差异结果哪里出了问题
-
bwa mem 迷一般的参数最近被bwa-mem -T参数搞迷糊了，不明白这个参数是如何发挥效用的。根据软件帮助文档对参数的描述，可知其功能是过滤输出结果，于是乎想当然地觉得它的作用是过滤掉alignm...
-
kallisto原理的图文详解，通俗易懂的专业内容最具吸引力看到一篇关于kallisto软件原理的文章，内容通过图文的形式详细地介绍了软件的工作原理，让读者能够直观地理解以便更好地使用软件，内容通俗易懂值得学习与分享。内容如下： ka...
-
telomere length and content estimating端粒是位于染色体末端的DNA的非编码重复序列，就像安全帽一样，保护着基因组。在人体细胞中，其初始长度为8-15kb，每复制一次，其长度便会减少50-200bp。当端粒长度达到...
-
cnvkit分析CNV，batch真的好用
最近需要分析CNV，所以学习了一下cnvkit软件。不得不说，软件的文档写得真的很详细，能够感受到给予使用者的满满诚意。无论是最新的文档，还是网上相关的帖子，都会看到下面的这...
-
CADD遗传变异打分，有害性的综合评估CADD (Combined Annotation–Dependent Depletion) 是一种基于 logistic 回归模型的评分系统，用于预测人类基因组中遗传变异的...
-
MSI分析工具如何选择，最好的原来是它微卫星 (Microsatellite) 通常由1-6个碱基为重复单元串联重复很多次形成，其位点遍布于基因组。在 DNA 复制负责错配修复 (MMR) 基因的功能存在缺陷时，...
-
manta分析SV的结果有点懵染色体SV (Structural Variation)变异包含Insertion、Deletion、Duplication、Inversions、Translocation...
-
annovar好用却又不完全会用
annovar作为老牌变异注释软件，用起来还是挺方便的，速度也挺快，可以输出txt格式的结果，是一个不错的选择。支持的输入格式有pileup、cg、cgmastervar、g...