在RNA-seq分析结果中经常会看到由两个主成分(PC1,PC2)绘制的PCA (principal component analysis)质控图,来反映样本间的远近关系...
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在RNA-seq分析结果中经常会看到由两个主成分(PC1,PC2)绘制的PCA (principal component analysis)质控图,来反映样本间的远近关系...
"枪响了""看到是谁开的枪了吗""看不清,他站在道德的制高点上,他在阳光下。" ——温特伯格《狩猎》 知其道,用其妙。 vect...
10x Visium空间转录组数据下游聚类时,可以分为两种策略:一是基于细胞类型相对比例聚类,二是基于基因表达值聚类。第二种与普通单细胞处理方法一致,第一种略有不同。 ...
Single-cell best practices学习资源所有内容如下: Introduction 1. Prior art[https://www.sc-best-pra...
一行代码即可简单优雅地搞定细胞比例堆叠条形图:
最近一直在用scanpy分析单细胞数据,真的是越用越顺手,但常在河边走哪有不湿鞋的呢?这不一不小心就给自己埋下了一个难以察觉的潜在问题。为什么这么说呢?因为这个问题通常情...
clusterProfiler包做富集分析后,可直接使用配套的可视化函数展示结果,最常见的形式有barplot、dotplot。网上有很多相关的推文,今天咱来说点不一样的...
有些问题来来回回,学了忘,忘了学,反反复复很多次,用到时依然是模糊的。之所以被遗忘,也许是问题本身不重要,没有什么存在感;也许是要学的东西很多,脑容量不够。Anyway,...