hello,今天我们继续来分享分析代码部分,这一次,我们直接用单细胞Seurat 的分析结果联合VDJ进行分析,话不多说,直接开始。 写出h5ad 开始分析,数据大家换成自己...
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1. Seurat对象查看当前的Assay 在进行了SCTransform操作后,矩阵默认会变成SCT矩阵,如果不加设置,后续的PCA等操作都是基于SCT矩阵。修改Defau...
今天接到一个小姑娘的咨询,她问我的公众号有没有兼职可以提供,她可以做一些简单的下游分析赚点外快。 我说没有呀。 科研服务是个苦差事 其实倒是经常有一些读者来求助,想要找我们做...
作者,追风少年i 时间很快,转眼就周四了,怎能因昨天的苦难而选择停留。 今天我们来分享一下关于空间转录组的轨迹分析问题。 在最开始,空间转录组分析还不是那么成熟的时候,对空间...
这一篇我们做一个详细的总结,周五了,疫情还没结束,父母也都老了,有时候真的感觉身为儿子实在不孝,常年在外,回家很少,家里有点事父母也不会跟我这个儿子说,小病小灾的也舍不得去医...
轨迹分析系列: 单细胞之轨迹分析-1:RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 单细胞之轨迹分析-2:mono...
之前写过三篇和CNV相关的帖子,如果你做肿瘤单细胞转录组,大概率看过: 单细胞分析实录(11): inferCNV的基本用法[https://www.jianshu.com/...