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数据分析工具推荐 | adaptive-m6A：从RNA序列中鉴定物种特异性m6A修饰位点m6A修饰是真核RNA中最丰富的共转录修饰，在细胞调控中发挥着重要作用。近日，《Briefings in Bioinformatics》发表了一...
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热点综述 | 基于人工智能的多组学分析助力癌症精准医学研究多组学技术和人工智能算法的同步发展推动了癌症精确医学的发展。2023年1月《Seminars in Cancer Biology》发表了一篇综述...
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NC | 使用GraphST对空间转录组进行空间信息聚类、整合和去卷积空间转录组技术生成具有空间背景的基因表达谱，需要空间信息分析工具来完成三个关键任务：空间聚类、多样本整合和细胞类型去卷积。近日，《Nature ...
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疾病研究资源 | 用于评估疾病相关性的生物医学数据、计算方法和工具探索疾病之间的潜在关系一直是一个活跃的研究领域。2022年《Briefings in Bioinformatics》发表了一篇综述文章，为当前的...
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Nature子刊 | 将对应分析（CA）应用于scRNA-seq数据的降维、批量整合和可视化有效降维对于scRNA-seq分析至关重要。主成分分析（PCA）被广泛使用，但需要连续的、正态分布的数据；因此，它经常与scRNA-seq应用中...
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数据分析工具推荐 | bulkAnalyseR：用于分析和共享批量多组学数据的交互式工具包批量测序实验（单组学和多组学）对于探索广泛的生物学问题至关重要。为了促进交互式、探索性任务以及共享易于访问的信息，《Briefings in B...
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BASS：为单细胞分辨率的空间转录组学提供多尺度和多样本分析
空间转录组学研究正在达到单细胞空间分辨率，数据通常来自多个组织切片。《Genome biology》发表了一种计算方法BASS，支持单细胞分辨率...
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热点综述 | 肿瘤微环境中的细胞间通信推断和分析：数据资源和计算策略
量化肿瘤微环境（TME）中各种细胞类型之间和内部的串扰，有助于开发用于肿瘤靶向治疗的工具。《Briefings in Bioinformatic...
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Nature子刊 | 空间转录组技术及其发展方向
2022年10月《Nature Biotechnology》发表了一篇空间转录组（ST）技术的综述文章，详细描述了现有的ST技术及其发展方向。 ...