发简信
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Nat. Rev. Genet. | 研究细胞相互作用和通讯的计算及实验工具近年来，研究细胞与细胞相互作用（CCIs） 的工具经历了显著的多样化。2024年1月，《Nature Reviews Genetics》发表综述...
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单细胞工具 | cnnImpute：基于卷积神经网络模型的全新scRNA-seq数据插补工具由于固有的低信噪比和存在过多的缺失值，单细胞测序（scRNA-seq）数据分析存在独特的挑战。2024年2月，《Scientific Repor...
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单细胞工具 | scGPT：利用生成式AI构建单细胞多组学基础模型生成式预训练模型在多个领域都取得了显著的成功。2024年2月，《Nature Methods》发表单细胞生物学的基础模型 scGPT，该模型是基...
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Nat. Biotechnol. | iStar：通过整合空间转录组学与组织学推断超分辨率组织结构空间转录组学（ST）在生成组织内细胞的复杂分子图谱方面显示出巨大的潜力。2024年1月，《Nature Biotechnology》发表了一种基...
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STOmicsDB升级助力科研数据共享|4步搞定空间组可视化数据集正在为复杂数据分析焦虑、正手忙脚乱调整paper配图、正在为如何推广自己科研成果头疼的各位科研人 快来体验STOmicsDB新功能——可视化数据...
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NCBI用不了？国家基因库早有准备4月2日，美国国立卫生研究院（NIH）主任办公室（OD）在网站上发布一份《实施更新：增强NIH受控访问数据的安全措施》文件，称自2025年4月4...
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单细胞工具 | 利用CellHint自动协调和整合人类细胞图谱数据集的细胞类型协调单细胞群体中的细胞类型，并将它们组装成一个共同的框架，是构建标准化人类细胞图谱的核心。2023年12月，《Cell》发表了一种基于树的预测聚...
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NC | scSpaMet：用于组织系统生物学的单细胞空间代谢组学与细胞类型特异性蛋白质分析癌细胞和免疫细胞会进行代谢重编程，以支持其在生物组织中日益增长的能量需求。为了满足同时进行全细胞代谢和蛋白质原位分析的需求，相关科研团队开发了s...
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NC | scRNA-seq数据跨物种整合算法的基准测试和策略指南来自不同物种的单细胞基因表达数据集越来越多，这为探索跨物种细胞类型之间的进化关系创造了机会。scRNA-seq数据的跨物种整合尤其具有参考价值。...