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m6A修饰是真核RNA中最丰富的共转录修饰，在细胞调控中发挥着重要作用。近日，《Briefings in Bioinformatics》发表了一种基于注意力的深度学习方法ad...

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多组学技术和人工智能算法的同步发展推动了癌症精确医学的发展。2023年1月《Seminars in Cancer Biology》发表了一篇综述文章，全面总结了基于人工智能的...

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空间转录组技术生成具有空间背景的基因表达谱，需要空间信息分析工具来完成三个关键任务：空间聚类、多样本整合和细胞类型去卷积。近日，《Nature Communications》...

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探索疾病之间的潜在关系一直是一个活跃的研究领域。2022年《Briefings in Bioinformatics》发表了一篇综述文章，为当前的疾病关联研究提供了一个系统的概...

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有效降维对于scRNA-seq分析至关重要。主成分分析（PCA）被广泛使用，但需要连续的、正态分布的数据；因此，它经常与scRNA-seq应用中的对数变换相结合，这可能会扭曲...

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批量测序实验（单组学和多组学）对于探索广泛的生物学问题至关重要。为了促进交互式、探索性任务以及共享易于访问的信息，《Briefings in Bioinformatics》发...

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空间转录组学研究正在达到单细胞空间分辨率，数据通常来自多个组织切片。《Genome biology》发表了一种计算方法BASS，支持单细胞分辨率空间转录组学的多尺度和多样本分...

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量化肿瘤微环境（TME）中各种细胞类型之间和内部的串扰，有助于开发用于肿瘤靶向治疗的工具。《Briefings in Bioinformatics》发表了一篇综述文章，介绍了...

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2022年10月《Nature Biotechnology》发表了一篇空间转录组（ST）技术的综述文章，详细描述了现有的ST技术及其发展方向。 检测生物分子的新技术一直是生物...

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近日，中国科学院院士、陆军军医大学第一附属医院病理科主任卞修武院士，以色列魏茨曼科学研究院Ido AMIT教授联合华大生命科学研究院徐讯研究员及西南团队，在国际期刊Life ...

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胚胎发育研究的重要性日益显现，这迅速增加了与多组学数据相关专业资源的数量。然而，缺乏全球胚胎发育库和系统分析工具，限制了干细胞研究、人类先天性疾病和辅助生殖领域的发展。202...

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识别空间域（即在基因表达和组织学上具有空间相关性的区域）是空间转录组学中最重要的课题之一。近日，《Nucleic Acids Research》发表了一个准确且通用的深度学习...

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2022年10月29日，由深圳国家基因库和深圳华大生命科学研究院共同研发的时空组学数据库V1.0版本（STOmicsDB）在国家基因库生命大数据平台（CNGBdb）正式上线，...

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空间分辨转录组分析可以揭示组织结构和环境依赖性细胞-细胞或细胞-环境相互作用的分子机制。由于目前的技术限制，以单细胞分辨率获得全基因组空间转录组是一项挑战。近日，《Scien...

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随着NGS技术的进步，许多疾病中人体组织的转录谱分析变得越来越常规，在公共存储库中已存储了PB级的数据。目前需要计算专业知识有限的实验室科学家能够访问和挖掘这些数据，以了解疾...

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全基因组关联研究（GWAS）为复杂疾病的遗传基础提供了见解。在下一步中，综合多组学方法可以表征相关原发组织中的分子特征，以揭示疾病发展的机制。近日，《Trends in Ge...

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癌症亚型识别是推进个性化抗癌治疗的关键步骤之一。然而目前从多组学数据中识别最相关的特征并系统地整合它们仍然存在局限性。近日，《Scientific Reports》发表了一种...

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在后基因组时代，蛋白质组学在生物医学研究中发挥着重要作用。近日，Nature子刊《Laboratory Investigation》发表了一篇高通量蛋白组的mini-revi...

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纵向微生物组研究可以捕捉微生物组内的时间变化，以获得对微生物系统的机理认识。近日，《Briefings in Bioinformatics》发表综述文章，回顾了纵向微生物组研...