小白要变大神

影响因子：12.4 研究概述：肝癌是全球第三大致癌死亡的原因，也是第六大常见的肿瘤类型。其中，肝细胞癌（HCC）为最常见的肝癌类型，其次为肝内胆管癌（ICC），这两种类型合计...

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影响因子：13 研究概述：癌细胞内在因素与肿瘤微环境（TME）之间的复杂相互作用决定了癌症的预后、进展和治疗效果。肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）是这一环境中高度多样化且复制的组...

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影响因子：27.7 研究概述：NK细胞是固有免疫淋巴细胞，能直接杀死病毒感染的细胞，并调控适应性免疫反应的早期阶段，在免疫反应中发挥重要作用。NK细胞通常分为两类：CD56b...

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空间转录组+单细胞联合分析---（SPOTlight最新版教程） 作者在2022年更新了SPOTlight脚本代码，或许有伙伴在运行以往的版本教程（https://marce...

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参考教程链接： https://github.com/dmcable/spacexr[https://github.com/dmcable/spacexr] 官方教程： ht...

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随着空间转录组技术的普及，越来越多的课题开始使用这一技术。当前，以10X Visium为代表的空间转录组技术是目前最常见的技术。然而，10X Visium由于技术本身的局限性...

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同名gzh：BBio //前言 对空间转录组的组织驻留细胞类型的复杂映射仍然是一个挑战。原因之一是器官间细胞的巨大多样性，包括无数细粒细胞类型，如免疫细胞、免疫细胞、基质细胞...

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随着单细胞技术的发展和普及，越来越多的课题组开始使用单细胞技术进行自己的课题研究。然而，在单细胞的注释上，商业公司提供的流程化注释往往难以满足实际的需求，甚至得到牛头不对马嘴...

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前面我们说过空间转录组技术不是真正的单细胞水平，每个spot会捕获5-10个细胞，这样每个spot里实际上可能存在几种不同类型的细胞。但是对于大部分组织细胞来说同一区域周围更...

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思考：来自运来大佬的笔记(现在走的路都是大佬为我们铺好的路，要学会珍惜！) 如何将空间数据与表达数据关联在一起？ 有了空间转录组数据，如何与单细胞转录组数据联用？ 做了多层切...

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hello，大家好，今天我们来分享一个新的空间注释的方法，当然主要思想还是解卷积，关于空间转录组的注释方法，我已经分享了很多了，在这里列举出来，供大家参考。 MIA用于单细胞...

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hello，大家好，今天我们来分享一下有关空间转录组研究肿瘤样本切片的一些思路，主要的参考文献是Comprehensive Analysis of Spatial Archi...

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空间转录组是2022生命科学十大创新产品名单，因此将来会在生物学领域有非常大的应用空间，目前植物类的相关文章较少，我也是在慢慢的学习中。我们测试数据选取兰花的空转数据：Spa...

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旧号无故被封，小号再发一次 更多空间转录组文章： 1. 新版10X Visium 【10X空间转录组Visium】（一）Space Ranger 1.0.0(更新于20191...

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hello，大家好，今天我们继续来分享关于10X空间转录组在肿瘤方面的研究，其实也和大家分享过很多次了，强调肿瘤正常边界的重要医学意义，而如果实现这个，就必须借助空间转录组技...

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由于基因表达跟细胞表面蛋白的表达具有时间差，所以要根据经验具体情况具体分析，内容仅供参考   哺乳类动物B细胞的分化过程主要可分为前B细胞、不成熟B细胞、 成熟B细胞、活化B...