影响因子：12.4 研究概述：肝癌是全球第三大致癌死亡的原因，也是第六大常见的肿瘤类型。其中，肝细胞癌（HCC）为最常见的肝癌类型，其次为肝内胆管癌（ICC），这两种类型合计...
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最新12+单细胞生信，探索DAB2+ Macro与FAP+ CAFs关系，高端生信值得模仿！ -
最新15分泛癌肿瘤相关巨噬细胞图谱，图谱构建需要太多背景知识，值得收藏！影响因子：13 研究概述：癌细胞内在因素与肿瘤微环境（TME）之间的复杂相互作用决定了癌症的预后、进展和治疗效果。肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）是这一环境中高度多样化且复制的组...
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最新15分泛癌肿瘤NK细胞图谱，NK细胞亚群鉴定参考依据。图谱构建需要太多背景知识，值得收藏！影响因子：27.7 研究概述：NK细胞是固有免疫淋巴细胞，能直接杀死病毒感染的细胞，并调控适应性免疫反应的早期阶段，在免疫反应中发挥重要作用。NK细胞通常分为两类：CD56b...
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空间转录组分析---SPOTlight（1.0.1版本）空间转录组+单细胞联合分析---（SPOTlight最新版教程） 作者在2022年更新了SPOTlight脚本代码，或许有伙伴在运行以往的版本教程（https://marce...
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空间转录组2022||空间数据反卷积RCTD分析：full mode on Visium hippocampus参考教程链接： https://github.com/dmcable/spacexr[https://github.com/dmcable/spacexr] 官方教程： ht...
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【生信实战】空间转录组反卷积——带你了解Spot里究竟都有点啥细胞随着空间转录组技术的普及，越来越多的课题开始使用这一技术。当前，以10X Visium为代表的空间转录组技术是目前最常见的技术。然而，10X Visium由于技术本身的局限性...
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文献速递||cell2location软件联合单细胞转录组进行空间转录组细胞映射同名gzh：BBio //前言 对空间转录组的组织驻留细胞类型的复杂映射仍然是一个挑战。原因之一是器官间细胞的巨大多样性，包括无数细粒细胞类型，如免疫细胞、免疫细胞、基质细胞...
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【生信实战】scRNA单细胞/ST空间转录组细胞注释完全指导手册随着单细胞技术的发展和普及，越来越多的课题组开始使用单细胞技术进行自己的课题研究。然而，在单细胞的注释上，商业公司提供的流程化注释往往难以满足实际的需求，甚至得到牛头不对马嘴...
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空间转录组第九讲：利用SingleR进行细胞类型注释
前面我们说过空间转录组技术不是真正的单细胞水平，每个spot会捕获5-10个细胞，这样每个spot里实际上可能存在几种不同类型的细胞。但是对于大部分组织细胞来说同一区域周围更...
