我们生活着的世界并非只有我们自己,而是有很多小于或大于我们的生物不断与我们交互着,有的让我们开心,有的使我们伤心。这就关系到一个本质的问题: 我是谁? 我是一个脑袋,一个躯体...
一、样品处理 1.1 Q:包埋过程应遵从什么原则?A: (1) 选取的组织要大小合适,便于后续实验操作。 (2) 取的组织要尽量新鲜,避免RNA降解。 (3) 选用合适的包埋...
更多内容请关注个人公众号---KS科研分享与服务---接上节(跟着Cell学单细胞转录组分析(三):单细胞转录组数据质控(QC)及合并去除批次效应[http://mp.wei...
按:RNA-seq 流程非常多样化,每一个步骤可选工具都非常多。我的选择是 StringTie 进行组装取得 read counts 数值,DESeq2 分析差异基因。这里把...
以前写过不少零散的 RNA-Seq 分析文章,现在整理为流程,同时修改一些错误。流程包含质控、比对、定量、差异分析。 前处理 拿到原始 fastq 数据先进行前处理。前处理包...
在我们涉足单细胞数据分析不久之后就会发现,我们在和一套新的理念打交道。在这套理念中,对象是常见的,数据是多维的,往往是一张核心表及其附属。我们对一张表是熟悉的,Excel极大...