IP属地：四川
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提取染色体对应三代hifi数据
近期做hic挂载发现一个物种的染色体有问题，需要把对应两条染色体的三代测序数据挑出，比对到两条染色体上查看深度，以及挑出这部分序列重新拼接，拿到...
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blastn报错
近期在集群跑几个污染分析的流程，从conda新装了blast，之后报错。 查询可知，是因为blastn版本跟不上，但事实上我安装了最新的blas...
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braker3注释基因组基因遇到的问题
1 安装 参照“基因组结构预测|Braker3流程”这篇知乎文章https://zhuanlan.zhihu.com/p/659050212[h...
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HiTE注释重复序列
使用conda安装HiTE 我本来打算安装好之后使用conda-pack迁移到服务器使用，运行之后发现有部分依赖并不能被conda-pack迁移...
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个人塔式服务器搭建-生物信息分析本文从1 功能需求，2 硬件选择，3 搭建过程 三个方面来阐述。 1 功能需求 最近在进行植物基因组的组装注释和分析流程，需要一台多线程的li...
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EDTA注释重复序列报错
使用conda安装好EDTA环境 运行后发现LTR鉴定过程报错 github搜索，发现问题与LTR_retriever有关，遂指定LTR_ret...
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解决Repeatmodeler运行报错
使用conda安装了Repeatmodeler，版本为Version 2.0.5。在基因组重复序列注释过程中运行时间 过长，而且最终产生的文件中...
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juicer挂载遇到的报错
conda配好环境之后，运行结果如下 经群友指点之后发现，在fastq文件夹中的hic测序文件格式，需要遵循_R1.fastq或者_R1.fas...
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转录组富集分析
根据b站基因课视频修改，按照输入文件名输出四个富集图像。