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    cutadapt 使用详解

    Cutadapt安装 基本命令 例子: 常用参数 参数详解 Removing adapters Adapter 移除 Anchored 5’ adapters:adapter...

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    生信 | 三维基因组技术(二):Hi-C辅助组装与Lachesis的使用

    写在前面 以下内容均来自我在菲沙基因(Frasergen[http://www.frasergen.com/])暑期生信培训班上记录的课堂笔记 1.Hi-C 辅助组装(PGA...

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    De novo组装#07 | 染色体挂载 (allhic,3d-dna)

    写在前面 初始组装经过基因组纠错(polish)以及去冗余(purge)之后,就可以将其挂载到染色体上,使其由contig/scaffold级别的基因组提升到chromoso...

  • 3D-DNA&Juicer升级单倍型基因组至染色体水平

    数据准备:单倍型基因组(hap1.p_ctg.fa和hap2.p_ctg.fa)和HIC数据 软件安装:3D-DNA、Juicer、BWA、Juicebox(win或mac安...

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    MCScanX共线性分析

    共线性 共线性片段是指一个同一个物种内部或者两个物种之间,由基因组复制、染色体复制、大片段复制以及物种分化而产生的大片段同源现象。同源片段内部基因排序保守,意味着功能上也可能...

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    「生信」共线性分析——MCScanX

    目录MCScanX下载及安装数据准备MCScanX运行及结果Ka & Ks 计算下游画图脚本最后 MCScanX有两个主要的功能, 一是, 方便使用者发现共线性(collin...

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    生信log14|生信自学不求人-靠谱学习资料总结和评价

    生信学习资料 自学生信不求人,现在网上资料越来越丰富,但是资料多也意味着鱼龙混杂,并且让人无从选择。正确做法应该是,找一个适合自己且完善靠谱的学习资料,从头到尾跟一遍,代码敲...