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RepeatMasker注释重复序列二RepeatMasker二.再次学习 2023年3月16日 9:28 近期通过看文献和接触到的新的重复序列注释工具，对RepeatMasker的...
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Genewise简介及安装
Genewise是Wise2软件的核心程序，在官网上自我介绍时说自己是Ensembl的pipeline 程序，有网友提到这是一个非常老的软件，最...
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文献解读前言： 最近在浙大学习，张老师分享给我近期Cell文章公布的南极磷虾的基因组最新研究，让我组会上讲一下，那就精读一下，看一下(想起导师前段时间分...
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利用宏基因组数据组装基因组-评估篇
前言： 最近组装了一种病原体的基因组，基因组大小为610kb，结果发现在300,000-400,000之间发现很多的Gap区域，需要找一下原因。...
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利用宏基因组数据组装某病原体基因组一(组装篇)一.前言： 有时候拿到某病原体感染病人的样本，未经培养而想获得病原体的基因组序列，直接利用二代测序获得进行宏基因组测序，通常思路就是通过bwa或...
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查看服务器CPU配置
前言： 从2017年10月份我开始转入生物信息学域工作学习，医学出身又都是自己学习(闭门造车)，一路来磕磕绊绊，对于计算机硬件的理解一直是我短板...
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高质量的肩突硬蜱基因组促进了蜱类科学的发展新年伊始，Nature Genetics公布了由美国Maryland大学科研人员对肩突硬蜱基因组进行测序组装的最新研究结果，这是第三版的肩突硬蜱...
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非Root用户安装Perl模块
在安装RepeatModeler-2.0.1时，第一步配置configure文件，perl configure时提醒没有安装Perl的File:...
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转录组比对软件STAR安装及使用发现服务器上没有安装STAR (Spliced Transcripts Alignment to a Reference)，这个转录组最常用的比...