前面介绍了怎么一行命令完成RNAseq差异分析加作图，那如果我们已经有自己重点关注的基因，并且想把这些基因在差异结果里展示出来怎么弄呢？ 今天再来介绍一下，做完差异分析之后怎...
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一行命令完成RNAseq数据标记重要基因
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Cytoscape插件1：Centiscape
Cytoscape的插件或多或少都有一些弊端，Centiscape是目前（文章时间2009）唯一一个可以一次计算多个中心值的插件（相对于network analysis等）....
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m6a RNA甲基化测序分析流程 rna甲基化研究方法
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MSKCC Research Associate<br>别赶不上野心，又辜负了努力
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视频在https://www.bilibili.com/video/av49363776 ，如果大家R语言能力不够，就主要学习网页工具 https://www.cbioportal.org/ 等等，如果R语言还行，就看代码: https://github.com/jmzeng1314/tcga_example 如果确实有需要，还可以看看我们的付费内容：地址是 http://jm.grazy.cn/index/mulitcourse/index.html
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一些生物信息学用到的软件，工具，介绍用法安装以及以及应用的文章 🛠 测序组装使用的Spades、canu等等 🛠 序列比对比如blast、bowtie、diamond等 🛠 多序列比对比如mega、clustalW、matff等 🛠 序列格式转化的samtools、bedtools等等 🛠 可变剪接分析的rMATS、MISO 🛠 微卫星序列查找工具misa等 🛠 call peak的工具macs2 🛠 文献下载工具Sci-hub桌面版 🛠 进化树构建工具IQtree、ggtree等 🛠 同源基因查找工具OrthoMCL、OrthoFinder等 🛠 寻找测序中的结构变异或者SNP序列GATK、bcftools等 🛠 宏基因组组装与分析的anvi'o、QIMME 🛠 测序质量评估的FastQC、BUSCO、QUAST 🛠 可视化工具比如IGV、3D Genome 🛠 测序数据下载工具SRA Toolkit、ascp等 🛠 数据可视化的工具circos 等等
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日记式的记录python历程
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分析方法流程
