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收录了12篇文章 · 4人关注
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    Cytoscape插件6：CluoGO+Cluepedia

    A: ClueGO:破译富集GO和通路 大多数的富集工具都是以列表和复杂等级树显示。Cluoego可视化归纳相似的过程或通路。主要是GO和KEG...

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    Cytoscape插件5：DisGeNET(2)应用实例

    1.在CTD里，哪些基因被注释到哮喘病相关 广泛的定义为“对于一个给定的基因集来说，哪些基因和某疾病相关？”哮喘病是一个严重的慢性疾病，有时会威...

    0.3 Y大宽 1 11
  • Cytoscape插件5：DisGeNET(1)

    基本功能 为了产生不同类型的网络，DisGeNET的控制面板提供了可以调整的参数。包含三个标签：gene disease network, di...

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    Cytoscape插件4：iRegulon

    对所有生物过程来说，基因表达的精确调控对基因表达是非常重要的。序列特异性的转录因子结合在DNA 识别区域（cis调控元件），并且因此控制目标基因...

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  • Cytoscape插件3：Enrichment Map(2)

    材料和方法 1.微阵列数据分析 所有的微阵列表达数据下载与GEO数据库。Raw.CEL文件用bioconductor的affy包进行RMA。数据...

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    Cytoscape插件3：Enrichment Map(1)

    富集分析 早期的基因列表解释依赖于选择一系列高得分的基因，然后建立相当主观奇怪的关系。富集分析是一个自动的，基于严格的统计学的方法来分析和解释很...

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    Cytoscape插件2：CytoHubba

    CytoHubba:发现复杂网络的关键目标和子网络网络对呈现包括PPI，基因调控，细胞路径和信号转导等多种类型生物数据非常有用。我们//+重要性...

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  • cytoscape及APP(插件)使用手册

    写在前面： 对于我们大多数来说，用图形或图表更比数据本身更能说明问题，更容易让人理解，并且可以赏心悦目。细胞内部，大量的分子时刻都在发生着变化或...

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  • Cytoscape插件1：Centiscape

    Cytoscape的插件或多或少都有一些弊端，Centiscape是目前（文章时间2009）唯一一个可以一次计算多个中心值的插件（相对于netw...

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    Cytoscape中文教程（3）

    Step by step 3鉴定一系列感兴趣的基因。 典型的是，这些基因是对你的实验调节反应比较强烈的基因（也就是差异基因）。下面讲描述三种和这...

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