问题 怎么去doublet?挑选出某一大类做小类降维聚类的时候,有人仍然会检查一下各种大类marker的表达情况,这一步是否有必要? 1 最有效的方法还是从上游入手,控制细胞...
问题 怎么去doublet?挑选出某一大类做小类降维聚类的时候,有人仍然会检查一下各种大类marker的表达情况,这一步是否有必要? 1 最有效的方法还是从上游入手,控制细胞...
我使用了scrublet和doubletfinder两种方法,发现结果差别非常大,预测的doublet很少有重合的,请问您遇到过这种情况吗?您有好的建议吗?可以付费咨询您吗?
答读者问(7):关于doublet问题 怎么去doublet?挑选出某一大类做小类降维聚类的时候,有人仍然会检查一下各种大类marker的表达情况,这一步是否有必要? 1 最有效的方法还是从上游入手,控制细胞...
@凌川美兮 应该不是,我是导入的一个差异基因列表,按理说总不能所有基因表达都具有相关性吧😂
TCGA数据差异分析后生存分析(批量单因素cox回归/Lasso筛选,多因素cox建模,时间依赖ROC曲线及KM plot可视化)测序上游分析系列: mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序pipeline:从raw r...
我和你恰好相反,我的全部过滤完了😂
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总结的真的太好了,请问能分享一下参考文献来源吗?非常感谢
基质细胞的注释成纤维细胞: The first CAF sub-cluster was comprised of 280 cells (16.2% of all stromal; red ...
成纤维细胞: The first CAF sub-cluster was comprised of 280 cells (16.2% of all stromal; red ...