问题 怎么去doublet？挑选出某一大类做小类降维聚类的时候，有人仍然会检查一下各种大类marker的表达情况，这一步是否有必要？ 1 最有效的方法还是从上游入手，控制细胞...
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答读者问(7)：关于doublet
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2021-07-31 细胞焦亡程序性细胞死亡(Programmed Cell Death, PCD)，是指细胞接受某种信号或受到某些因素刺激后，为了维持内环境稳定而发生的一种主动性消亡过程。凋亡、自噬、细...
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SCTransform：单细胞样本的标准化Seurat从3.0版本引进了SCTransform这个函数用来对数据做标准化，并且这一个函数可以代替三个函数（NormalizeData, ScaleData, FindV...
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10X单细胞（10X空间转录组）TCR（BCR）数据分析之洛伦兹曲线和ball-packing plotshello，大家好，今天我们学习一些简单的内容，关于我们单细胞测序得到的TCR、BCR分析得到的数据如何进行良好的展示，我们来看看下面的分析部分。参考文章为Single-ce...
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SingleR细胞类型鉴定SingleR计算每个细胞表达谱与每个参考样品的表达谱之间的Spearman相关性，相关分析仅对参考数据集中的变异基因(variable genes)进行。使用相关分布的固定...
