像鸟一样飞过你的高山

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单细胞测序细胞类型鉴定——肥大细胞
肥大细胞特性肥大细胞（mast cell），发育源于骨髓CD34+前体细胞，广泛分布于皮肤及内脏粘膜下的微血管周围，组织中肥大细胞不多，是连接...

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samtools Bam文件常用操作
BAM文件flag记录 1：该read是成对的paired reads中的一个2：paired reads中每个都正确比对到参考序列上4：该re...

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linux下R 语言安装
Linux环境下安装R 报错:configure: error: libcurl >= 7.28.0 library and headers a...

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mask RCNN实现实例分割
2017年Google公司开放了TensorFlow Object Detection API，该项目实现了多种深度学习框架，包括mask RC...

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单细胞测序GSVA基因集变异分析
GSVA基因集变异分析结合limma包分析差异基因集基因集变异分析即GSVA（Gene set variation analysis）,是一种...

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ComplexHeatmap相关性分析绘制热图
加载包、数据使用Hmisc包rcorr()函数计算一个矩阵的所有可能的列的皮尔逊或斯皮尔曼相关系数，对于大量的基因数据，该方法非常快。Comp...

0.3 1532 0 3
linux BLAST序列比对（nt/nr库）
安装本地blast序列比对软件，我们可以搜索一个查询序列定制数据库，例如想研究一个新测序的基因组，或者感兴趣的一组蛋白质序列。有时我们希望把程序...

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Seurat 报错-namespace:spatstat
加载Seurat包报错，莫名其妙，之前用的好好的。不知道什么时候安装包存在兼容性问题，只能先删除掉。

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STAR序列比对（测试支原体污染序列）
转录组测序发现唯一比对率特别低，进一步将未比对到参考基因组的序列提出来比对到NCBI NT库。发现多数序列比对到了Mycoplasma hyor...

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