无意中翻到生信大神果子老师和洲更老师神仙大家的帖子，样本足够多时非参数检验就够用了（DESeq2可以先等等）。wx搜索：《学好统计，我10分钟就...
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TCGA差异分析|1.非参数检验
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TCGA数据挖掘下载流程 数据较多时，用gdc-client，下载后配置环境变量 将之前manifest下载的txt文件找到：“gdc_manifest_202...
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基于R对TCGA患者临床数据整理和Cox分析
一、数据整理 1 导入数据 利用data.table包导入数据，以LUAD为例 2 选择感兴趣的临床信息 一般常规项包括submitter_id...
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TCGA样本编号什么意思？之前分析TCGA数据都是直接匹配barcode，其规则懂的不多。相信有不少同志也有这方面困惑。 这里给出两份资料，一份是TCGA官方英文介绍，链...
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从TCGA下载的临床数据处理下载的临床数据因为我分析的比较简单，所以就只讲KM生存分析和阶段分析。1、数据下载 这个很简单，你选择你关心的肿瘤类型，然后加入购物车，然后点击...
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等了好久的B站TCGA笔记（1-2章）B站视频地址：https://www.bilibili.com/video/av49363776?from=search&seid=177090...
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TCGAbiolinks下载表达谱数据及临床数据加载包 library(TCGAbiolinks)library(dplyr)library(DT)library(SummarizedExpe...
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TCGA的差异基因分析在分析TCGA数据库里的RNA-seq数据之前，先了解一下TCGA样本的id名称里的小秘密：参考文章：TCGA的样本id里藏着分组信息 根据文章...
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TCGA数据库介绍
转载：https://biozx.top/TCGA-introduce.html[https://biozx.top/TCGA-introduc...
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TCGA数据整合后进行DESeq2差异表达分析和基于R的多种可视化测序上游分析系列： mRNA-seq转录组二代测序从raw reads到表达矩阵：上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量测序...
专题公告
TCGA
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