同一物种的同一个组织,在不同的样本或者处理之间,相同细胞类型中基因表达的 差异分析
http://www.360doc.com/content/21/0714/12/76149697_986499764.shtml
https://zhuanlan.zhihu.com/p/601553301
1. 基于零膨胀福二项分布
1.1 MAST
GitHub: https://github.com/RGLab/MAST/
http://www.360doc.com/content/23/0314/22/76149697_1072023761.shtml
1.2 SCDE
https://www.jianshu.com/p/162c76674b3d
https://blog.csdn.net/AIPuFu/article/details/100591001
1.3 DEsingle
输出结果解读:
- 使用
norm_foldChange
和pvalue.adj.FDR
做最终的判别
norm_foldChange = total_mean_1/total_mean_2
,注意其中的顺序