这次要练习的文章数据出自：Spatially and functionally distinct subclasses of breast cancer-associated...
发简信
IP属地：黑龙江
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单细胞测序实战（第一部分） -
10X空间转录组速率分析（Velocyto）之SIRVhello，大家好，今天我们来分享Velocyto如何在空间上的运用，10X单细胞数据做RNA Velocyto大家应该都已经不陌生了吧，相信很多人都做过，大家也应该很了解R...
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10X单细胞（10X空间转录组）RNA速率分析之scVelo今天我们测试一下软件scVelo，这个软件应该很多人都用过了，但是玩的好的人，应该没几个。 加载 读取数据（loom, h5ad, csv）, 我的数据是根据velocyto...
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scVelo 的使用: 从bam和Seurat获取输入数据到画图
1.数据准备 用10x数据做scVelo，输入数据分2部分: Seurat 分析后的数据: 聚类、基因、细胞信息。 velocyto run 输出的loom文件，记录 spl...
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基于Seurat UAMP和celltype的RNA Velocity速率分析的全套流程参考资料：参考生物技能树[https://mp.weixin.qq.com/s/TJsdj7qesZGlvmEkNLAy0A]Velocyto官网Tutorial[https...
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单细胞之轨迹分析-6：velocyto.R+Seurat轨迹分析系列： 单细胞之轨迹分析-1：RNA velocity[https://www.jianshu.com/p/ee0f7a8e6a06] 单细胞之轨迹分析-2：mono...
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RNAvelocity系列教程4：velocyto.R的使用教程
RNA注释 这里以inDrop 实验数据举例，spliced/unspliced的RNA可以通过： 1.使用dropEst 输出管道生成 类似10X的 bam 文件： 2.使...
