您好,请问一下这个结果可以复刻出来嘛 最近正在复刻里面肾脏的数据 (10x下的) 最后得到的TE特异性位点的tsv 文件感觉怪怪的 不知道能不能帮忙看一下😭
SpatialTE:从空间转录组数据集分析转座因子表达的工具 | 空间转录组分析工具推荐空间转录组学(ST)正在改变我们研究基因表达的方式。然而在大量转录组数据中,转座因子(TE)由于其高度重复性而未被研究。近年来,TEs被认为是基因表达的重要调节因子。因此,以...
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目前关于空间转录组学的许多文献是技术性的,并不面向不熟悉该领域的研究人员。近日,《Genome Medicine》发表了一篇综述文章为空间转录组学提供了一个入门指南:涵盖了生...
识别空间域(即在基因表达和组织学上具有空间相关性的区域)是空间转录组学中最重要的课题之一。近日,《Nucleic Acids Research》发表了一个准确且通用的深度学习...
空间转录组学(ST)正在改变我们研究基因表达的方式。然而在大量转录组数据中,转座因子(TE)由于其高度重复性而未被研究。近年来,TEs被认为是基因表达的重要调节因子。因此,以...
还在羡慕海峡那边的朋友下载SRA 快到飞起?还在难过用wget 下载数据经常下载不完整?用了官方的下载工具还是慢的不行?这里有一个SRA 下载自救尝试指南供你参考。 需要用到...
重复序列广泛存在于真核生物基因组中, 这些重复序列或集中成簇, 或分散在基因之间。根据分布把重复序列分为散在重复序列和串联重复序列。 重复序列的分类 重复序列注释流程 参考脚...
作者,Evil Genius 这一篇我们继续分享关于空间通讯的内容,今天偷个懒。 10X Visium HD平台已经发布,高精度平台,配套loupe软件,看起来几乎是无敌的,...
学习目标 学习用DiffBind流程评估两个样本间的差异结合区域 用PCA评估样本间的关系 评估不同工具得到的差异peaks的一致性 评估差异peaks富集的工具 ATAC-...
首先附上软件链接:https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/systemPipeR.htmlhttp:/...
我们关注蛋白质的功能,而结构和功能联系紧密。一旦在氨基酸序列水平发现有趣的序列(比如一个模体(motif)或者进化上保守的片段),下一步往往就是研究这段序列的3-D结构。(...