尐尐呅

目前关于空间转录组学的许多文献是技术性的，并不面向不熟悉该领域的研究人员。近日，《Genome Medicine》发表了一篇综述文章为空间转录组学提供了一个入门指南：涵盖了生...

尐尐呅

识别空间域（即在基因表达和组织学上具有空间相关性的区域）是空间转录组学中最重要的课题之一。近日，《Nucleic Acids Research》发表了一个准确且通用的深度学习...

尐尐呅

空间转录组学（ST）正在改变我们研究基因表达的方式。然而在大量转录组数据中，转座因子（TE）由于其高度重复性而未被研究。近年来，TEs被认为是基因表达的重要调节因子。因此，以...

思考问题的熊

还在羡慕海峡那边的朋友下载SRA 快到飞起？还在难过用wget 下载数据经常下载不完整？用了官方的下载工具还是慢的不行？这里有一个SRA 下载自救尝试指南供你参考。 需要用到...

Bioinfor生信云

重复序列广泛存在于真核生物基因组中, 这些重复序列或集中成簇, 或分散在基因之间。根据分布把重复序列分为散在重复序列和串联重复序列。 重复序列的分类 重复序列注释流程 参考脚...

单细胞空间交响乐

作者，Evil Genius 这一篇我们继续分享关于空间通讯的内容，今天偷个懒。 10X Visium HD平台已经发布，高精度平台，配套loupe软件，看起来几乎是无敌的，...

六六_ryx

学习目标 学习用DiffBind流程评估两个样本间的差异结合区域 用PCA评估样本间的关系 评估不同工具得到的差异peaks的一致性 评估差异peaks富集的工具 ATAC-...

小潤澤

首先附上软件链接：https://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/systemPipeR.htmlhttp:/...