前面已经简单介绍过GWAS的概念,GWAS分析中所用到的文件以及分析流程,我们在GWAS分析结果文件中经常会看到beta值和P值,他们分别代表什么意思?这两个值又有什么关系呢...
前言 当我们获得一堆“感兴趣”/“有意义”的SNPs之后, 怎样知道这些SNPs所在的基因呢? 不要告诉我一个一个在pubmed查就好~ 我们需要知道Plink哪个参数可以帮...
孟德尔随机化推断暴露因素与健康结局的因果关系[https://www.jianshu.com/p/8ac31267d3d8] TwoSampleMR:两样本孟德尔随机化[ht...
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引言 GWAS与eQTL都是用于研究基因位点与表型之间关系的手段,彼此之间存在很多的区别与联系。 GWAS 全基因组关联分析(Genome Wide Association ...
五一学了一个新的分析方法-CIBERSORT,这个包其实很早就想学的,因为现在一般的单细胞文章的套路,很难不用到它,那么它能干什么呢?它能够推测出bulk RNA每一个样本中...
都2022年了,竟然还有孟德尔随机化能发IF > 10的文章!!!敲黑板,重点:所用数据全都是公共数据,完全可以复现!!!孟德尔随机化YYDS欢迎留言,大家一起总结一下202...
简介[#toc_0] Mamba是在c++中对conda的重新实现,可以认为是更高级的conda。有以下特点使用多线程并行下载数据和package,实现更高效的安装libso...
hello,大家好,今天我们来分享多组学数据推断RNA Velocyto,大家做velocyto的时候估计都是用RNA数据来分析的,其实,对应的ATAC数据也含有丰富的动力学...