前面已经简单介绍过GWAS的概念，GWAS分析中所用到的文件以及分析流程，我们在GWAS分析结果文件中经常会看到beta值和P值，他们分别代表什么意思？这两个值又有什么关系呢...
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GWAS分析-P值和beta值的爱恨相杀 (六) -
GWAS分析-说人话（15）- 如何查看SNP所在的基因前言 当我们获得一堆“感兴趣”/“有意义”的SNPs之后， 怎样知道这些SNPs所在的基因呢？ 不要告诉我一个一个在pubmed查就好～ 我们需要知道Plink哪个参数可以帮...
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多变量孟德尔随机化MVMR孟德尔随机化推断暴露因素与健康结局的因果关系[https://www.jianshu.com/p/8ac31267d3d8] TwoSampleMR：两样本孟德尔随机化[ht...
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Radial MR：两样本孟德尔随机化的radial plot孟德尔随机化推断暴露因素与健康结局的因果关系[https://www.jianshu.com/p/8ac31267d3d8] TwoSampleMR：两样本孟德尔随机化[ht...
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生信笔记5-GWAS与eQTL引言 GWAS与eQTL都是用于研究基因位点与表型之间关系的手段，彼此之间存在很多的区别与联系。 GWAS 全基因组关联分析（Genome Wide Association ...
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CIBERSORT：反卷积推测bulk中的细胞类型五一学了一个新的分析方法-CIBERSORT，这个包其实很早就想学的，因为现在一般的单细胞文章的套路，很难不用到它，那么它能干什么呢？它能够推测出bulk RNA每一个样本中...
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盘点2022年孟德尔随机化高分文章
都2022年了，竟然还有孟德尔随机化能发IF > 10的文章！！！敲黑板，重点：所用数据全都是公共数据，完全可以复现！！！孟德尔随机化YYDS欢迎留言，大家一起总结一下202...
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生信软件安装神器 Mamba [conda加速器~]简介[#toc_0] Mamba是在c++中对conda的重新实现,可以认为是更高级的conda。有以下特点使用多线程并行下载数据和package，实现更高效的安装libso...
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10X单细胞（10X空间转录组）多组学（RNA + ATAC）推断Velovyto（MultiVelo）hello，大家好，今天我们来分享多组学数据推断RNA Velocyto，大家做velocyto的时候估计都是用RNA数据来分析的，其实，对应的ATAC数据也含有丰富的动力学...
