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IP属地：青海
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Mafft Trimal Fasttree建树导读 barrnap预测细菌基因组16S，获取结果文件第二行最长16S，保留>1400bp的16S。mafft做序列对齐。trimal修剪序列。fasttree建树。ggtr...
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@爱吃海椒的妹妹下面共有序列有小写字母，大写字母和数字，数字貌似是表示极性？
利用GeneDoc美化同源比对结果
软件准备：GeneDoc下载地址http://www.jalview.org/getdown/release/[http://www.jalview.org/getdown/...
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2025-02-04本人运行admixture两个月，至今未找到问题根源可以解决，参考数据都不行，实在崩溃不已。。。太难了，难道走错行业了，望简书的家人们能帮我找到问题所在 （通过conda安装...
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你好，比对后共有序列含有数字是啥含义呀？
利用GeneDoc美化同源比对结果
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群体遗传学之个体间遗传距离及其计算方法
01-Definition Genetic Distance Genetic distance is the degree of genetic difference (ge...
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遗传背景分析（群体结构10个样品以上）
2020.11.9【GWAS/WGS流程】丨全基因组关联分析绘图全流程_穆易青的博客-CSDN博客_gwas全基因组关联分析[https://blog.csdn.net/ya...
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博主，我运行admixture，没有结果文件.P和.Q，也不报错，不论是.ped还是.bed作为输入文件，都没结果，救救孩子吧
Linux 安装admixture
1、安装VMware tools或挂载共享文件夹2、下载anacondahttps://repo.anaconda.com/archive/[https://repo.ana...
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对于最适m值会有多次重复，那么绘制树图时最适m值的第几次重复可以当做最后结果呢？每一个重复的结构都不太一样
【群体遗传】Treemix四倍体分析 & 最优m值选择
距离上一次写博客，已经是上一次了。 之前已经有生信菜鸟团前辈写过关于Treemix的分析，但值得关注的是，现在的软件大部分都只适用于二倍体，那今天介绍一下四倍体怎么进行Tre...
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【群体遗传】Treemix四倍体分析 & 最优m值选择距离上一次写博客，已经是上一次了。 之前已经有生信菜鸟团前辈写过关于Treemix的分析，但值得关注的是，现在的软件大部分都只适用于二倍体，那今天介绍一下四倍体怎么进行Tre...
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群体进化分析--基因流及群体历史分析——我愿称之为史上最全基因流（也称基因迁移）是指从一个物种的一个种群向另一个种群引入新的遗传物质，从而改变群体“基因库”的组成。通过基因交流向群体中引入新的等位基因，是遗传变异一个非常重要的来源，...
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5. GWAS：群体结构——Admixture群体结构是指材料的亚群分化情况，会导致标记间的非连锁关联，进而导致关联分析结果出现假阳性。 地理隔离、人工选择、移民和遗传漂变等都可能导致群体分化。 是指遗传变异在物种或群体...
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生信小工具：Plink之下载安装与其基本格式（1）
谈起Plink相信熟悉的人更定都会知道，这是一个全面的基因组分析工具集，具有很多的小功能，在SNP数据统计，过滤，GWAS分析中都可以用得上，而且速度非常的快，堪称是生物信息...
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同求，超到的ks咋过滤
全基因组复制分析（WGD）
全基因组复制 全基因组复制事件是物种的染色体由于某种原因整体复制加倍的事件； 大多数被子植物都经历过多倍化事件； 物种在自然选择压力较大的时候可能会发生全基因组复制来丰富自己...
