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有时需要十几二十个配色,但是一般的配色方案只有10个左右。用连续型的颜色方案虽然可以轻松获得很多配色,但是相邻变量的差异不够很难用于观察,尤其对...
数据准备ASV_table和tax_table,即asv丰度表和asv的注释表其次需要安装Hmisc和igraph这两个包 输出结果:①netw...
计算网络节点模块内连通度(within modular degree)和模块间连通度(between modular degree)_网络的连通...
首先获得对应数据的ACC号。这个在NCBI中选择好数据后,选择send to - file - Acc list然后下载即可 对于单个的数据文...
ggtree导入数据 通常情况下,我们需要对ID进行一定的修改,那么我们可以执行一下操作 这样一来即可完成树枝的名称更换 指定外围枝 绘制基础图...
进入存放fasta序列的文件夹下 --prefix 输出文件名前缀--outdir 输出文件夹--kingdom 注释模式 {Archaea|B...
写在前面:本文内容翻译自anvi'o的官方社区,若有疑惑的地方请各位优先前往官网进行查阅原文!!![https://merenlab.org/2...
写在前面:鉴于本人想用这个软件分析泛基因组,但是并没有找到合适的中文说明,那就只好翻英文说明,并顺手翻译了一下。本文档主要根据官方原泛基因组分析...