陈有朴 - 简书

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Jupyter Lab | “丢下R，一起来快乐地糟蹋服务器！”
写作前面工具永远只是为了帮助自己提升工作效率 —— 沃兹基·硕得所以说，为什么要使用jupyterlab呢？当然是因为基于服务器来处理数据就...

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同源基因鉴定 | OrthoFinder 2.0 + MAFFT + IQtree
写在前面写这个贴子纯粹为了记录一下自己的双面打工人的生活，然后再总结一下自己的工作方法还有哪些地方存在问题，希望下次再遇到这些小问题的时候可以...

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「数据不给下，那就试试scrapy吧！」
写在前面声明一下代码不是我写的，“我不生产代码，我只是代码的搬运工” 本文目的是稍微记录和分享，如何使用srapy来爬取OMIM数据库，学习P...

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「来绘图吧！」链特异性测序的read depth绘制
以酿酒酵母为例，用到的数据如下，随便找一个链特异性测序的fastq用常见比对软件跑一下都行。有一些数据我放在github，可参考：https:/...

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读《Python神经网络编程》| “小学二年级都能学会的神经网络编程”
神经网络、AI等词汇出现的频率在现如今是非常高的。非人工智能专业的同学有没有必要学呢？当出现了线性方法不可以解决的生物学问题时，神经网络就应...

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方法解读 | 性染色体Phasing
本篇文章学习、解析的内容来自《Genomes of the Banyan Tree and Pollinator Wasp Provide In...

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「干活」基因组组装之前要做的：Genome Survey
基因组组装之前，有一些问题还是需要注意的， genome size是多少？评估得到的genome heterozygosity是多少？重复序...

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服务器网络丢包率100%，连接不上外网怎么办？
一个简单的记录服务器选址不对，时不时会发生丢包的问题，重启路由器无果，结果root权限下一行命令搞定了，后话网络知识不能丢，偶尔搞搞服务器...

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「干活」基因组组装学习笔记 - 入门知识点和Genome Survey
基因组组装学习笔记（一）基因组组装的前期工作：需要掌握什么知识点？ 1）基因组大小 / genome size：一般有两种办法，使用流式细胞...

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