说在前面： 早在 2009 年，韩斌团队（第一作者是黄学辉）就在 Genome Res 上发了一篇文章 High-throughput genotyping by whole...
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SNPbinner 构建定位群体的基因组 bin 图谱 -
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言简意赅
一套比较简便的基因组组装流程
这套流程主要特点是消耗资源比较少，1G以内的基因组，内存不要低于128G，最好能搞到256G，但是再多对这套流程用不上，更大的基因组没有测试过。 测序数据为100x以上的Pa...
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使用Pandas合并多个表格
大家好，我是小刘歌。介绍一个使用Pandas合并多个表格的程序。废话不多说，直接上代码。 使用 mamba install -n base -c conda-forge pa...
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【GWAS】为TASSEL结果绘制曼哈顿图及QQ图好久没写博文了，分享一个为TASSEL结果绘制曼哈顿图的代码： 结果如下： QQ 图的结果有点异常，请忽略。 欢迎大家大家关注「小刘哥」公众号，进行交流。
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@wanghaolin 就是你关联分析的结果
绘制 SNP 密度图
一般使用 CMplot 绘制SNP密度图：包链接：https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要绘制 SNP 密度图，仅仅需要三列即可：a. 第...
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@小梁学生信 还没写哦
一步一步学会撰写SNP Calling 流程（二）
3.1 DNASeq 数据分析SNP/Indel 策略 策略一： BWA + Samtools /Picard + GATK 1) BWA 比对及 Samtools 转化为 ...
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@Vivian冉 就是标记的染色体及物理位置。只需要示例数据中的前三列即可。
绘制 SNP 密度图
一般使用 CMplot 绘制SNP密度图：包链接：https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要绘制 SNP 密度图，仅仅需要三列即可：a. 第...
