说在前面: 早在 2009 年,韩斌团队(第一作者是黄学辉)就在 Genome Res 上发了一篇文章 High-throughput genotyping by whole...
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言简意赅
一套比较简便的基因组组装流程这套流程主要特点是消耗资源比较少,1G以内的基因组,内存不要低于128G,最好能搞到256G,但是再多对这套流程用不上,更大的基因组没有测试过。 测序数据为100x以上的Pa...
大家好,我是小刘歌。介绍一个使用Pandas合并多个表格的程序。废话不多说,直接上代码。 使用 mamba install -n base -c conda-forge pa...
好久没写博文了,分享一个为TASSEL结果绘制曼哈顿图的代码: 结果如下: QQ 图的结果有点异常,请忽略。 欢迎大家大家关注「小刘哥」公众号,进行交流。
@wanghaolin 就是你关联分析的结果
绘制 SNP 密度图一般使用 CMplot 绘制SNP密度图:包链接:https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要绘制 SNP 密度图,仅仅需要三列即可:a. 第...
@小梁学生信 还没写哦
一步一步学会撰写SNP Calling 流程(二)3.1 DNASeq 数据分析SNP/Indel 策略 策略一: BWA + Samtools /Picard + GATK 1) BWA 比对及 Samtools 转化为 ...
@Vivian冉 就是标记的染色体及物理位置。只需要示例数据中的前三列即可。
绘制 SNP 密度图一般使用 CMplot 绘制SNP密度图:包链接:https://github.com/YinLiLin/R-CMplot 要绘制 SNP 密度图,仅仅需要三列即可:a. 第...
@Alexander_Le 多看看小骆驼书
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@shwzhao 是根据exon提取的,可以设置的
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@shwzhao 是的,gffread好的很
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