前述,我们提起,王骁老铁开发了一个 TBtools-Rplugin。这个 Plugin 事实上是一个 R ShinyApp。使用这个插件,几乎所有人可以在自己的电脑上轻松完成...
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前面的文章中完成了数据导入和网络构建,下面是将基因模块与性状进行关联,从而识别与表型相关的重要基因。WGCNA(1):R包安装及数据导入清洗 - 简书 (jianshu.co...
简介 这是一款2017年发表在NAR上的注释LncRNA的工具,FEELnc: a tool for long non-coding RNA annotation and i...
首先我是这是我日常逛 twitter 看到的,然后我又是一个搬运工( emmm,这个系列都没有询问作者意见,后面如果有意外就删了。 ) 书籍在线版:R for Data Sc...
ggh4x是ggplot2的扩展包,其火星文发音为G-G-hacks。主要功能包括调整分面大小(adjusting the sizes of facets),mapping ...
重演一篇傻瓜式GWAS分析|培养兴趣专用[https://zhuanlan.zhihu.com/p/139428767] 发布于 2020-05-10 18:58 全基因组关...
哈喽,我想问一下,不同物种(远缘)的重测序数据为什么可以比对到不同物种上,并且还具备较高的覆盖深度。
测序数据的深度、覆盖度等计算Coverage Depth 覆盖深度 mapping depth 基因组被测序片段(短读 short reads)“覆盖”的强度有多大? 每一碱基的覆盖率是基因组碱基被测序...
文末可下载示例数据和代码。 前几天,老师让我画一个这样的图。 粗略一看,似乎没有什么特别困难的地方,好像之前也看到过类似的图,但是看到老师发来的链接才发现这居然是Nature...
写本篇文章,主要目的是从tmp文件和软件运行信息解读亚基因组分型分析。 进入tmp文件夹之后,其实就可以看到对应的文件: 如何查看什么步骤产生了怎么样的结果文件? 上述在进行...